60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1860 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1860  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  333  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2894  hypothetical protein  68.42 
 
 		 152 aa  218  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000016603  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2020  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  72.8 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3208  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  71.2 
 
 		 137 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346323  normal  0.0537298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2511  hypothetical protein  70.4 
 
 		 137 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0201  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  40.94 
 
 		 288 aa  93.6  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03637  Potential redox protein  34.82 
 
 		 131 aa  83.6  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223227  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000970  cell division inhibitor  35.94 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  34.65 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15765  normal  0.357312 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07021  hypothetical protein  38.28 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2108  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.77 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310466  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3850  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  36.23 
 
 		 293 aa  80.9  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.386494 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04751  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.154576  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0931  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.64 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4819  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.42 
 
 		 289 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04851  hypothetical protein  32.06 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5411  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.42 
 
 		 289 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398056  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5450  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  35.42 
 
 		 289 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488662 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3164  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.25 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.600155  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04441  hypothetical protein  34.23 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.141762  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1482  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.02 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.469356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0236  hypothetical protein  36.36 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.368645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4062  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.77 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0170887  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15521  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0715  hypothetical protein  30 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1605  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  33.04 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2144  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  38.78 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1409  hypothetical protein  30.71 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2743  hypothetical protein  39.29 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3338  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.89 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0615  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.89 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.72548  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0771  hypothetical protein  30.36 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2077  hypothetical protein  36.36 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.949648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3508  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.08 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0568  hypothetical protein  31.25 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1941  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  37.72 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0206301 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1840  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.93 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0181  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  29.93 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11891  hypothetical protein  30.89 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.811967  normal  0.0619225 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0517  hypothetical protein  27.13 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0121  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.43 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1838  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  30.77 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1687  hypothetical protein  33.96 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1814  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  28.93 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3218  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  26.79 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00144282  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10574  predicted protein  28.95 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3684  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.78 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.316801  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07171  hypothetical protein  31.06 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0675  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.916492  normal  0.175959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3626  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.81 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.95092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0610  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.78 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1691  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  31.21 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.411404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5381  hypothetical protein  35.45 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.919604  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3808  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0344386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0767  hypothetical protein  33.07 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1922  hypothetical protein  21.36 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6771  hypothetical protein  29.63 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32698  predicted protein  28.32 
 
 		 770 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.782214  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0353  putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC  25.71 
 
 		 122 aa  41.2  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>