More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0621 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  100 
 
 
260 aa  527  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  97.69 
 
 
260 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  70.31 
 
 
260 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  70.24 
 
 
260 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  69.14 
 
 
270 aa  364  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  67.19 
 
 
266 aa  363  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  67.33 
 
 
260 aa  355  5e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  64.2 
 
 
271 aa  343  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  67.77 
 
 
277 aa  336  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  60.32 
 
 
285 aa  328  4e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  62.85 
 
 
270 aa  321  9.000000000000001e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  63.24 
 
 
270 aa  320  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  62.02 
 
 
275 aa  318  7e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  62.06 
 
 
270 aa  315  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  62.15 
 
 
270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  61.26 
 
 
272 aa  312  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  61.87 
 
 
271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  58.63 
 
 
270 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  60.31 
 
 
269 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  60.96 
 
 
284 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  62.75 
 
 
270 aa  305  5.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.96 
 
 
267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  58.33 
 
 
265 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  60.96 
 
 
267 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  58.33 
 
 
265 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  57.81 
 
 
265 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  60 
 
 
268 aa  301  6.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  60.25 
 
 
265 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  59.68 
 
 
268 aa  300  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  57.6 
 
 
279 aa  299  4e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  57.14 
 
 
272 aa  295  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  57.14 
 
 
272 aa  295  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  58.43 
 
 
283 aa  294  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  58.43 
 
 
283 aa  294  8e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  58.43 
 
 
283 aa  294  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  56.52 
 
 
272 aa  293  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  57.74 
 
 
268 aa  292  4e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  54.9 
 
 
285 aa  292  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.08 
 
 
286 aa  292  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  59.61 
 
 
282 aa  291  6e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.33 
 
 
286 aa  290  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  56.1 
 
 
267 aa  290  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  59.6 
 
 
270 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.03 
 
 
271 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  59.22 
 
 
279 aa  289  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  57.77 
 
 
273 aa  289  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  56.63 
 
 
276 aa  287  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  59 
 
 
268 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  57.08 
 
 
266 aa  285  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  55.28 
 
 
267 aa  285  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  55.28 
 
 
267 aa  285  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  52.55 
 
 
266 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  55 
 
 
267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  57.5 
 
 
268 aa  282  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  59.84 
 
 
270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  54.88 
 
 
267 aa  281  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  56.5 
 
 
307 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  55.74 
 
 
272 aa  281  9e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  53.31 
 
 
269 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  54.81 
 
 
267 aa  280  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  53.2 
 
 
267 aa  279  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  55 
 
 
267 aa  278  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  57.87 
 
 
265 aa  278  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  56.49 
 
 
278 aa  278  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  57.44 
 
 
271 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  56.57 
 
 
282 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  56.57 
 
 
282 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  56.57 
 
 
282 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  53.94 
 
 
267 aa  276  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  53.94 
 
 
267 aa  276  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  54.58 
 
 
273 aa  275  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  55.56 
 
 
268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  56.52 
 
 
280 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  47.88 
 
 
280 aa  265  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  51 
 
 
266 aa  255  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  49.39 
 
 
266 aa  245  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  48.99 
 
 
267 aa  237  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  48.58 
 
 
267 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  48.58 
 
 
267 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  48.58 
 
 
267 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  32.08 
 
 
263 aa  109  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.43 
 
 
278 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.59 
 
 
308 aa  106  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  29.9 
 
 
263 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  29.9 
 
 
263 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  34.21 
 
 
4917 aa  93.6  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  29.57 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.4 
 
 
291 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.3 
 
 
290 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.54 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  30.54 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  28.29 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  31.49 
 
 
4844 aa  83.2  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  28.29 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  28.29 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  28.29 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  28.29 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  28.29 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  28.29 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  28.29 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>