27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0143 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0143  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  761    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00850  hypothetical protein  96.74 
 
 		 399 aa  675    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0095739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2311  hypothetical protein  65.91 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  hitchhiker  0.0000274996 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1318  protein of unknown function DUF214  46.73 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0465  protein of unknown function DUF214  39.4 
 
 		 410 aa  249  7e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4234  hypothetical protein  37.75 
 
 		 410 aa  239  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.496459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52020  permease protein of ABC transporter  41.35 
 
 		 407 aa  230  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2627  hypothetical protein  38.61 
 
 		 407 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2876  ABC transporter, permease protein, putative  38.86 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3221  protein of unknown function DUF214  37.57 
 
 		 395 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.612368  normal  0.761835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1840  hypothetical protein  40.25 
 
 		 408 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3149  hypothetical protein  33.83 
 
 		 410 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.750768  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3421  ABC transporter related  36.75 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.952582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3869  hypothetical protein  37.66 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000457394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3132  hypothetical protein  38.71 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0592357  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4057  hypothetical protein  33.24 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058101  normal  0.267304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0902  protein of unknown function DUF214  33.62 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1668  protein of unknown function DUF214  36.28 
 
 		 609 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1002  protein of unknown function DUF214  25.38 
 
 		 700 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.95364  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 		 422 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1090 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  29.38 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  28.89 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  29.86 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  29.86 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.5 
 
 		 863 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  27.7 
 
 		 488 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>