More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1925 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  100 
 
 
360 aa  725    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56 
 
 
369 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.69 
 
 
361 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.42 
 
 
367 aa  353  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.29 
 
 
348 aa  347  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4968  putative flavoprotein  51.27 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1635  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  49.47 
 
 
398 aa  308  9e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26460  predicted flavoprotein involved in K+ transport  45.16 
 
 
396 aa  269  7e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18210  Predicted flavoprotein involved in K+ transport  44.64 
 
 
401 aa  264  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  38.66 
 
 
363 aa  228  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1908  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.38 
 
 
357 aa  227  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.47 
 
 
358 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.57 
 
 
375 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1026  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.55 
 
 
352 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565957  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1246  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.92 
 
 
385 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0314824  normal  0.095353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13150  predicted flavoprotein involved in K+ transport  36.16 
 
 
376 aa  192  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2381  oxidoreductase  35.07 
 
 
374 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222759  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07290  predicted flavoprotein involved in K+ transport  36.02 
 
 
447 aa  187  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160769  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2384  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.69 
 
 
378 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0867216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4245  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.42 
 
 
393 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2135  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.44 
 
 
360 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17600  predicted flavoprotein involved in K+ transport  36.02 
 
 
372 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1432  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.77 
 
 
359 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3364  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.24 
 
 
363 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.15 
 
 
374 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.67 
 
 
362 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  33.61 
 
 
364 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.22 
 
 
362 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34990  predicted flavoprotein involved in K+ transport  37.13 
 
 
361 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.675799  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1512  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.62 
 
 
356 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2189  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.35 
 
 
349 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  27.4 
 
 
347 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  27.68 
 
 
347 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  27.4 
 
 
347 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  27.4 
 
 
347 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  27.4 
 
 
347 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  27.12 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.68 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.22 
 
 
372 aa  145  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  27.12 
 
 
347 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  25.85 
 
 
347 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.14 
 
 
377 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.71 
 
 
378 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  27.2 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02550  potassium transporter (Trk family)  28.78 
 
 
343 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.16 
 
 
348 aa  132  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.9 
 
 
361 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.75 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.02 
 
 
352 aa  125  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.75 
 
 
360 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3146  flavin-containing monooxygenase FMO  29.39 
 
 
371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.88 
 
 
358 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 
382 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 
382 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.51 
 
 
381 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.51 
 
 
381 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.51 
 
 
381 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
382 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2813  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.43 
 
 
442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.311511  normal  0.0577283 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  27.24 
 
 
558 aa  114  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.63 
 
 
399 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.01 
 
 
427 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3504  flavin-containing monooxygenase FMO  28.3 
 
 
468 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3468  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.07 
 
 
381 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3273  flavin-containing monooxygenase FMO  28.33 
 
 
468 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.304511  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4746  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.83 
 
 
428 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137781  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 
419 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.85 
 
 
422 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  33.84 
 
 
419 aa  92.8  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2087  monooxygenase flavin-binding family protein  29.28 
 
 
490 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0469238  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3259  monooxygenase, flavin-binding  29.28 
 
 
494 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.206652  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3145  monooxygenase, flavin-binding  29.28 
 
 
499 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1114  monooxygenase flavin-binding family protein  29.28 
 
 
491 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1474  flavin-binding monooxygenase-like protein  29.28 
 
 
494 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6179  hypothetical protein  33.82 
 
 
450 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2346  monooxygenase flavin-binding family protein  29.41 
 
 
482 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4856  Flavin-containing monooxygenase  29.27 
 
 
447 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909027 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2625  hypothetical protein  31.05 
 
 
415 aa  90.5  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623222  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1820  flavin-containing monooxygenase FMO  27.38 
 
 
466 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3710  flavin-containing monooxygenase FMO  29.32 
 
 
407 aa  90.1  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2378  monooxygenase flavin-binding family protein  28.95 
 
 
491 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0583  flavin-containing monooxygenase FMO  29.43 
 
 
449 aa  89.4  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1393  monooxygenase flavin-binding family protein  28.95 
 
 
491 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71210  hypothetical protein  33.68 
 
 
450 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4567  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 
430 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.469601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2881  flavin-containing monooxygenase FMO  33.98 
 
 
609 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.389842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 
422 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.15 
 
 
422 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2070  Flavin-containing monooxygenase  26.48 
 
 
432 aa  86.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2056  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 
445 aa  85.9  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  33.51 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  32.49 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.54 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00083188  normal  0.623853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2709  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 
429 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1414  hypothetical protein  30.69 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.66 
 
 
448 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 
440 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2098  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 
430 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.59787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>