81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0728 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0728  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  806    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7108  hypothetical protein  40.18 
 
 		 358 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5512  hypothetical protein  37.56 
 
 		 771 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29441  hypothetical protein  35.13 
 
 		 693 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1630  hypothetical protein  32.75 
 
 		 754 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1417  hypothetical protein  31.3 
 
 		 779 aa  209  6e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.196003  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1751  hypothetical protein  30.81 
 
 		 779 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0314  hypothetical protein  32.04 
 
 		 774 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0660  hypothetical protein  29.3 
 
 		 815 aa  176  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.81909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3394  hypothetical protein  33.42 
 
 		 795 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0014  hypothetical protein  32.66 
 
 		 814 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1404  hypothetical protein  30.15 
 
 		 990 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.549738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0771  hypothetical protein  29.68 
 
 		 1022 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  37.5 
 
 		 793 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.35 
 
 		 867 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  37.5 
 
 		 804 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  36.11 
 
 		 793 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  27.81 
 
 		 907 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  39.73 
 
 		 805 aa  47.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3304  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  62.5 
 
 		 556 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0467  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  41.79 
 
 		 576 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688262  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  32.93 
 
 		 799 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  32.93 
 
 		 799 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  28.92 
 
 		 803 aa  46.6  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2756  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.5 
 
 		 573 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0793  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  35.14 
 
 		 950 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0827  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  35.14 
 
 		 950 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  21.82 
 
 		 868 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  21.89 
 
 		 869 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2861  multiphosphoryl transfer protein  28.93 
 
 		 844 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  22.15 
 
 		 869 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4084  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  44.64 
 
 		 580 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.814023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0153  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  36.99 
 
 		 599 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.786047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0160  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  36.99 
 
 		 598 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0954  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase,EI/HPr/EIIA components  36.25 
 
 		 955 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0171  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  36.99 
 
 		 598 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  36.92 
 
 		 950 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2007  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  35.9 
 
 		 556 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2648  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  32.97 
 
 		 958 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  36.92 
 
 		 873 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0821  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  36.25 
 
 		 956 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0946111 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0158  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  36.99 
 
 		 599 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.771311  normal  0.152518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 794 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1162  phosphoenolpyruvate synthase  32 
 
 		 799 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0246  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  45 
 
 		 585 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0816  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  35.14 
 
 		 950 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.289705 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  36.62 
 
 		 812 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  37.04 
 
 		 814 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  42.31 
 
 		 821 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  21.5 
 
 		 887 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  36.51 
 
 		 971 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4116  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  62.5 
 
 		 556 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  32.86 
 
 		 795 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1461  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  34.21 
 
 		 566 aa  43.9  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3011  phosphoenolpyruvate synthase  24.78 
 
 		 795 aa  43.9  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  33.8 
 
 		 790 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1184  PEP-utilising enzyme, mobile region  36.76 
 
 		 592 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.627285  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  39.71 
 
 		 812 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  33.78 
 
 		 868 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  32.86 
 
 		 819 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12190  fructose-specific multiphosphoryl transfer protein  38.03 
 
 		 957 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  32.39 
 
 		 795 aa  43.5  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1039  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  38.6 
 
 		 743 aa  43.5  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1734  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  32.97 
 
 		 543 aa  43.5  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.13402  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  33.75 
 
 		 801 aa  43.5  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0981  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  34.72 
 
 		 588 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  38.71 
 
 		 1115 aa  43.1  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  34.29 
 
 		 797 aa  43.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18250  putative phosphotransferase system enzyme I  43.1 
 
 		 956 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.184677  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  32.86 
 
 		 795 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0610  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  39.29 
 
 		 838 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.56309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1583  putative phosphotransferase system enzyme I  43.86 
 
 		 956 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1133  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  39.66 
 
 		 744 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000186405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  31.65 
 
 		 796 aa  43.1  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1607  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  40.74 
 
 		 587 aa  43.1  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4400  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  45.83 
 
 		 950 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  37.68 
 
 		 809 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2800  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.1 
 
 		 582 aa  43.1  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2622  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  40 
 
 		 584 aa  43.1  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0793  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  42.86 
 
 		 953 aa  42.7  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391363  normal  0.339751 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  38.24 
 
 		 810 aa  42.7  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>