54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0551 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0551  MORN domain-containing protein  100 
 
 
642 aa  1306    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0603  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  86.14 
 
 
577 aa  1030    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0596  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  95.49 
 
 
577 aa  1076    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0772523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1093  hypothetical protein  60.28 
 
 
579 aa  646    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0590  MORN repeat-containing protein  97.68 
 
 
603 aa  1152    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3811  MORN repeat-containing protein  60.51 
 
 
577 aa  646    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11900  hypothetical protein  61.87 
 
 
579 aa  659    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.55763  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4983  hypothetical protein  72.03 
 
 
575 aa  828    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291511  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0733  MORN repeat family protein  69.12 
 
 
575 aa  762    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0236191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0634  MORN motif-containing protein  67.5 
 
 
575 aa  748    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1518  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  39.92 
 
 
500 aa  166  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00370729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2722  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  38.89 
 
 
500 aa  164  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3087  MORN repeat-containing protein  36.61 
 
 
350 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250081  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3034  MORN repeat-containing protein  35.93 
 
 
350 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1718  hypothetical protein  38.2 
 
 
466 aa  153  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255426  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0600  MORN repeat-containing protein  34.38 
 
 
468 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347615  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0516  hypothetical protein  43.72 
 
 
454 aa  151  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1594  MORN repeat-containing protein  36.8 
 
 
500 aa  152  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1997  hypothetical protein  37.45 
 
 
493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06082  hypothetical protein  40.58 
 
 
361 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00845  hypothetical protein  40.58 
 
 
361 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210026  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3345  MORN motif-containing protein  35.64 
 
 
507 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2332  hypothetical protein  36.43 
 
 
501 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1007  MORN repeat-containing protein  36.43 
 
 
501 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0854  MORN repeat-containing protein  33.99 
 
 
488 aa  144  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133708  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2279  hypothetical protein  35.82 
 
 
500 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.416244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0943  hypothetical protein  42.03 
 
 
519 aa  141  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707363  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2389  MORN repeat-containing protein  32.56 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7222  hypothetical protein  34.9 
 
 
514 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0191551  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1887  PEGA domain-containing protein  33.8 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34720  predicted protein  29.54 
 
 
576 aa  108  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7823  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  43.51 
 
 
271 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0849  MORN repeat-containing protein  33.66 
 
 
538 aa  106  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.10958  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3530  MORN repeat-containing protein  35.36 
 
 
202 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.364919 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19094  predicted protein  32.93 
 
 
226 aa  102  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.762529  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10974  predicted protein  31.85 
 
 
312 aa  101  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10093  predicted protein  31 
 
 
315 aa  94.7  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0975626  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3361  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  35 
 
 
265 aa  87.4  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259599  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_850  predicted protein  27 
 
 
662 aa  87  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2559  MORN repeat-containing protein  29.47 
 
 
216 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0654  phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase  31.06 
 
 
167 aa  81.6  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21704  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1013  MORN motif-containing protein  32.42 
 
 
245 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0633058  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11352  predicted protein  29.91 
 
 
211 aa  79.7  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0412501  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0297  MORN repeat-containing protein  34.29 
 
 
248 aa  72.8  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.424224  normal  0.101065 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10781  predicted protein  33.78 
 
 
160 aa  72  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30154  predicted protein  33.33 
 
 
172 aa  66.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.82692  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_944  predicted protein  33.94 
 
 
107 aa  61.6  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1911  hypothetical protein  38.96 
 
 
136 aa  60.1  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2278  hypothetical protein  27.62 
 
 
212 aa  58.2  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0051  MORN motif-containing protein  34.07 
 
 
126 aa  58.5  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000239093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6615  MORN repeat-containing protein  34.31 
 
 
356 aa  54.3  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08074  MATH and UCH domain protein, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_5G01750)  26.19 
 
 
1319 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.499613 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0751  hypothetical protein  28.29 
 
 
407 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.914209  normal  0.0303897 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.47 
 
 
309 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>