35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2278 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2278  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  432  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2279  hypothetical protein  32.61 
 
 
500 aa  75.9  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.416244 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3345  MORN motif-containing protein  32.47 
 
 
507 aa  73.6  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0854  MORN repeat-containing protein  34.92 
 
 
488 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133708  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3811  MORN repeat-containing protein  33 
 
 
577 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0849  MORN repeat-containing protein  32.84 
 
 
538 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.10958  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2332  hypothetical protein  31.25 
 
 
501 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1007  MORN repeat-containing protein  31.25 
 
 
501 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19094  predicted protein  32.27 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.762529  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1594  MORN repeat-containing protein  31.03 
 
 
500 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0600  MORN repeat-containing protein  26.17 
 
 
468 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347615  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10974  predicted protein  29.47 
 
 
312 aa  60.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3087  MORN repeat-containing protein  27.81 
 
 
350 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250081  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3034  MORN repeat-containing protein  27.81 
 
 
350 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1887  PEGA domain-containing protein  28.65 
 
 
461 aa  58.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08074  MATH and UCH domain protein, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_5G01750)  46.77 
 
 
1319 aa  58.5  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.499613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0551  MORN domain-containing protein  27.62 
 
 
642 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34720  predicted protein  28.32 
 
 
576 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11352  predicted protein  34.11 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0412501  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10093  predicted protein  30.2 
 
 
315 aa  55.5  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0975626  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2389  MORN repeat-containing protein  29.76 
 
 
352 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1013  MORN motif-containing protein  26.29 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0633058  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1093  hypothetical protein  28.26 
 
 
579 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11900  hypothetical protein  28.51 
 
 
579 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.55763  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3530  MORN repeat-containing protein  31.51 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.364919 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0654  phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase  28.75 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21704  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0634  MORN motif-containing protein  26.39 
 
 
575 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0590  MORN repeat-containing protein  27.85 
 
 
603 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0733  MORN repeat family protein  27.71 
 
 
575 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0236191  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30154  predicted protein  27.22 
 
 
172 aa  45.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.82692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4983  hypothetical protein  27.98 
 
 
575 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291511  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2296  hypothetical protein  35.06 
 
 
106 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000811573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2559  MORN repeat-containing protein  29.71 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0603  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  26.94 
 
 
577 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0596  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  26.17 
 
 
577 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0772523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>