54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0596 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0551  MORN domain-containing protein  95.49 
 
 		 642 aa  1076    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0603  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  87.35 
 
 		 577 aa  1039    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0596  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  100 
 
 		 577 aa  1168    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0772523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1093  hypothetical protein  59.75 
 
 		 579 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0590  MORN repeat-containing protein  95.49 
 
 		 603 aa  1079    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3811  MORN repeat-containing protein  59.75 
 
 		 577 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11900  hypothetical protein  61.33 
 
 		 579 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.55763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4983  hypothetical protein  72.45 
 
 		 575 aa  833    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0634  MORN motif-containing protein  68.03 
 
 		 575 aa  758    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0733  MORN repeat family protein  69.27 
 
 		 575 aa  771    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0236191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1518  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  39.76 
 
 		 500 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00370729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2722  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  38.89 
 
 		 500 aa  164  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1718  hypothetical protein  38.2 
 
 		 466 aa  157  6e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3087  MORN repeat-containing protein  33.14 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0516  hypothetical protein  43.72 
 
 		 454 aa  153  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1997  hypothetical protein  37.45 
 
 		 493 aa  153  8e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3034  MORN repeat-containing protein  32.56 
 
 		 350 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0600  MORN repeat-containing protein  34.06 
 
 		 468 aa  151  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1594  MORN repeat-containing protein  36.43 
 
 		 500 aa  148  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00845  hypothetical protein  40.58 
 
 		 361 aa  148  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210026  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06082  hypothetical protein  40.58 
 
 		 361 aa  148  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3345  MORN motif-containing protein  35.64 
 
 		 507 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0854  MORN repeat-containing protein  34.65 
 
 		 488 aa  144  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1007  MORN repeat-containing protein  36.06 
 
 		 501 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2332  hypothetical protein  36.06 
 
 		 501 aa  144  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0943  hypothetical protein  42.03 
 
 		 519 aa  141  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2279  hypothetical protein  35.45 
 
 		 500 aa  140  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.416244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2389  MORN repeat-containing protein  30 
 
 		 352 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7222  hypothetical protein  37.18 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0191551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1887  PEGA domain-containing protein  33.49 
 
 		 461 aa  114  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7823  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  43.51 
 
 		 271 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0849  MORN repeat-containing protein  34.01 
 
 		 538 aa  106  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.10958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34720  predicted protein  35.75 
 
 		 576 aa  106  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3530  MORN repeat-containing protein  38.51 
 
 		 202 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.364919 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10974  predicted protein  32.22 
 
 		 312 aa  100  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19094  predicted protein  32.79 
 
 		 226 aa  99.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.762529  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10093  predicted protein  31.37 
 
 		 315 aa  94  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0975626  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3361  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  32.33 
 
 		 265 aa  89  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2559  MORN repeat-containing protein  29.47 
 
 		 216 aa  87  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_850  predicted protein  26.67 
 
 		 662 aa  84.7  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1013  MORN motif-containing protein  33.52 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0633058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0654  phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase  29.55 
 
 		 167 aa  79.7  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11352  predicted protein  31.63 
 
 		 211 aa  79.3  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0412501  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10781  predicted protein  33.8 
 
 		 160 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0297  MORN repeat-containing protein  36.04 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.424224  normal  0.101065 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30154  predicted protein  33.33 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.82692  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_944  predicted protein  33.94 
 
 		 107 aa  61.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1911  hypothetical protein  40.26 
 
 		 136 aa  60.8  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0051  MORN motif-containing protein  35.16 
 
 		 126 aa  56.6  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000239093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6615  MORN repeat-containing protein  35.29 
 
 		 356 aa  53.9  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0751  hypothetical protein  27.78 
 
 		 407 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.914209  normal  0.0303897 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.53 
 
 		 309 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2278  hypothetical protein  26.17 
 
 		 212 aa  43.9  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08074  MATH and UCH domain protein, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_5G01750)  27.78 
 
 		 1319 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.499613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>