45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2559 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2559  MORN repeat-containing protein  100 
 
 
216 aa  431  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2389  MORN repeat-containing protein  37.5 
 
 
352 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3530  MORN repeat-containing protein  33.16 
 
 
202 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.364919 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3087  MORN repeat-containing protein  34.55 
 
 
350 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250081  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3345  MORN motif-containing protein  33.51 
 
 
507 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3034  MORN repeat-containing protein  33.01 
 
 
350 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1594  MORN repeat-containing protein  34.57 
 
 
500 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2279  hypothetical protein  33.64 
 
 
500 aa  95.5  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.416244 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2332  hypothetical protein  34.76 
 
 
501 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1007  MORN repeat-containing protein  34.76 
 
 
501 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0634  MORN motif-containing protein  33.94 
 
 
575 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0854  MORN repeat-containing protein  33.51 
 
 
488 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133708  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0733  MORN repeat family protein  33.48 
 
 
575 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0236191  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0551  MORN domain-containing protein  34.12 
 
 
642 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19094  predicted protein  34.07 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.762529  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0590  MORN repeat-containing protein  34.12 
 
 
603 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0603  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  32.76 
 
 
577 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0596  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  34.6 
 
 
577 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0772523 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0600  MORN repeat-containing protein  31.96 
 
 
468 aa  86.3  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347615  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10974  predicted protein  35.71 
 
 
312 aa  85.9  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0849  MORN repeat-containing protein  31.09 
 
 
538 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.10958  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1093  hypothetical protein  35.14 
 
 
579 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10093  predicted protein  32.99 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0975626  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3811  MORN repeat-containing protein  31.69 
 
 
577 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1887  PEGA domain-containing protein  33.53 
 
 
461 aa  82  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11900  hypothetical protein  34.59 
 
 
579 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.55763  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4983  hypothetical protein  31.96 
 
 
575 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291511  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_850  predicted protein  29.12 
 
 
662 aa  74.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1013  MORN motif-containing protein  29.82 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0633058  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11352  predicted protein  31.49 
 
 
211 aa  72  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0412501  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34720  predicted protein  30.11 
 
 
576 aa  68.6  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0654  phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase  29.38 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21704  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30154  predicted protein  31.5 
 
 
172 aa  63.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.82692  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10781  predicted protein  29.93 
 
 
160 aa  63.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6615  MORN repeat-containing protein  36.63 
 
 
356 aa  58.9  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0051  MORN motif-containing protein  36.21 
 
 
126 aa  53.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000239093  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_944  predicted protein  36.08 
 
 
107 aa  52.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1911  hypothetical protein  30.83 
 
 
136 aa  50.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93578  predicted protein  33.33 
 
 
686 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000533165  normal  0.01596 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0297  MORN repeat-containing protein  39.24 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.424224  normal  0.101065 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24687  predicted protein  35.37 
 
 
730 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.818146  normal  0.14787 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08074  MATH and UCH domain protein, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_5G01750)  25.58 
 
 
1319 aa  46.2  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.499613 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0602  hypothetical protein  30 
 
 
385 aa  45.1  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2278  hypothetical protein  29.71 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_95034  predicted protein  37.88 
 
 
505 aa  42.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.234943  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>