39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2296 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2296  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000811573  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1007  MORN repeat-containing protein  48.57 
 
 
501 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2332  hypothetical protein  48.57 
 
 
501 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_95034  predicted protein  43.94 
 
 
505 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.234943  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1594  MORN repeat-containing protein  41.98 
 
 
500 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08074  MATH and UCH domain protein, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_5G01750)  38.89 
 
 
1319 aa  57  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.499613 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10093  predicted protein  40 
 
 
315 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0975626  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0854  MORN repeat-containing protein  31.2 
 
 
488 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133708  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11352  predicted protein  38.46 
 
 
211 aa  53.9  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0412501  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3345  MORN motif-containing protein  33.33 
 
 
507 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3087  MORN repeat-containing protein  38.75 
 
 
350 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250081  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2279  hypothetical protein  39.51 
 
 
500 aa  52.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.416244 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3034  MORN repeat-containing protein  37.5 
 
 
350 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0600  MORN repeat-containing protein  35.8 
 
 
468 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347615  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93578  predicted protein  37.35 
 
 
686 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000533165  normal  0.01596 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34720  predicted protein  34.41 
 
 
576 aa  51.2  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0654  phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase  37.66 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21704  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19094  predicted protein  36.96 
 
 
226 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.762529  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0849  MORN repeat-containing protein  35.8 
 
 
538 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.10958  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10974  predicted protein  31.78 
 
 
312 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1013  MORN motif-containing protein  36.36 
 
 
245 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0633058  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10781  predicted protein  34.52 
 
 
160 aa  47  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24687  predicted protein  31.73 
 
 
730 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.818146  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  39.36 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2389  MORN repeat-containing protein  38.96 
 
 
352 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2278  hypothetical protein  35.06 
 
 
212 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3530  MORN repeat-containing protein  34.04 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.364919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6615  MORN repeat-containing protein  32.91 
 
 
356 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_850  predicted protein  29.41 
 
 
662 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  32.91 
 
 
769 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  32.91 
 
 
769 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  32.91 
 
 
770 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  31.33 
 
 
770 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  31.33 
 
 
770 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1887  PEGA domain-containing protein  33.75 
 
 
461 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  31.33 
 
 
770 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  31.65 
 
 
770 aa  41.2  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  30.12 
 
 
770 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  30.49 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0500798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>