58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4983 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0551  MORN domain-containing protein  72.13 
 
 
642 aa  810    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0603  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  71.61 
 
 
577 aa  844    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0596  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  72.55 
 
 
577 aa  816    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0772523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1093  hypothetical protein  63.24 
 
 
579 aa  680    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0590  MORN repeat-containing protein  72.13 
 
 
603 aa  812    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3811  MORN repeat-containing protein  61.62 
 
 
577 aa  677    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11900  hypothetical protein  63.96 
 
 
579 aa  695    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.55763  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4983  hypothetical protein  100 
 
 
575 aa  1166    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291511  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0733  MORN repeat family protein  73.18 
 
 
575 aa  798    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0236191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0634  MORN motif-containing protein  71.86 
 
 
575 aa  791    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1518  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  39.75 
 
 
500 aa  159  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00370729 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1594  MORN repeat-containing protein  38.29 
 
 
500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2722  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  36.89 
 
 
500 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0854  MORN repeat-containing protein  35.44 
 
 
488 aa  153  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133708  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1007  MORN repeat-containing protein  37.92 
 
 
501 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2332  hypothetical protein  37.92 
 
 
501 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0600  MORN repeat-containing protein  35.69 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347615  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3345  MORN motif-containing protein  34.43 
 
 
507 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3087  MORN repeat-containing protein  35.13 
 
 
350 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250081  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3034  MORN repeat-containing protein  31.78 
 
 
350 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06082  hypothetical protein  39.21 
 
 
361 aa  144  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00845  hypothetical protein  39.21 
 
 
361 aa  144  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210026  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2279  hypothetical protein  33.94 
 
 
500 aa  141  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.416244 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1718  hypothetical protein  35.21 
 
 
466 aa  139  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255426  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1997  hypothetical protein  37.29 
 
 
493 aa  136  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0516  hypothetical protein  39.72 
 
 
454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0943  hypothetical protein  36.13 
 
 
519 aa  130  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707363  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2389  MORN repeat-containing protein  35.66 
 
 
352 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1887  PEGA domain-containing protein  34.27 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7222  hypothetical protein  35.89 
 
 
514 aa  116  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0191551  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10974  predicted protein  35.93 
 
 
312 aa  115  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7823  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  43.88 
 
 
271 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3530  MORN repeat-containing protein  39.29 
 
 
202 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.364919 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34720  predicted protein  29.82 
 
 
576 aa  107  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19094  predicted protein  33.6 
 
 
226 aa  105  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.762529  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0849  MORN repeat-containing protein  31.74 
 
 
538 aa  100  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.10958  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_850  predicted protein  30.56 
 
 
662 aa  90.1  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10093  predicted protein  30.77 
 
 
315 aa  89.7  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0975626  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3361  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  38.06 
 
 
265 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259599  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11352  predicted protein  30.8 
 
 
211 aa  82.4  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0412501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2559  MORN repeat-containing protein  31.62 
 
 
216 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0654  phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase  30.3 
 
 
167 aa  78.2  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21704  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10781  predicted protein  33.33 
 
 
160 aa  76.6  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1013  MORN motif-containing protein  29.21 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0633058  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30154  predicted protein  34.01 
 
 
172 aa  66.6  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.82692  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1911  hypothetical protein  41.98 
 
 
136 aa  63.2  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0297  MORN repeat-containing protein  42.86 
 
 
248 aa  62.4  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.424224  normal  0.101065 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_944  predicted protein  38 
 
 
107 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0051  MORN motif-containing protein  39.76 
 
 
126 aa  59.3  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000239093  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08074  MATH and UCH domain protein, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_5G01750)  35 
 
 
1319 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.499613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6615  MORN repeat-containing protein  35.35 
 
 
356 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.01 
 
 
578 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.01 
 
 
579 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_95034  predicted protein  29.17 
 
 
505 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.234943  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.01 
 
 
578 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.35 
 
 
729 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1406  hypothetical protein  38.75 
 
 
106 aa  44.3  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.06994  normal  0.423403 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2278  hypothetical protein  27.98 
 
 
212 aa  44.3  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>