21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2722 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1518  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  89.4 
 
 
500 aa  778    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00370729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2722  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  100 
 
 
500 aa  997    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0516  hypothetical protein  45.09 
 
 
454 aa  240  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1718  hypothetical protein  34.02 
 
 
466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255426  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1997  hypothetical protein  34.02 
 
 
493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0943  hypothetical protein  42.64 
 
 
519 aa  209  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707363  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06082  hypothetical protein  45.18 
 
 
361 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00845  hypothetical protein  45.18 
 
 
361 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3811  MORN repeat-containing protein  42.29 
 
 
577 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11900  hypothetical protein  39.37 
 
 
579 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.55763  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1093  hypothetical protein  39.76 
 
 
579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0590  MORN repeat-containing protein  39.91 
 
 
603 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0603  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  39.22 
 
 
577 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7222  hypothetical protein  32.84 
 
 
514 aa  161  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0191551  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0596  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  39.04 
 
 
577 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0772523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0551  MORN domain-containing protein  39.04 
 
 
642 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0733  MORN repeat family protein  40 
 
 
575 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0236191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4983  hypothetical protein  37.45 
 
 
575 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291511  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0634  MORN motif-containing protein  38.72 
 
 
575 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7823  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  37.5 
 
 
271 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3361  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  34.69 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>