21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1718 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1718  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  944    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1997  hypothetical protein  98.28 
 
 		 493 aa  930    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1518  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  36.36 
 
 		 500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00370729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2722  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  41.31 
 
 		 500 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0516  hypothetical protein  36.73 
 
 		 454 aa  179  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0943  hypothetical protein  33.96 
 
 		 519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0603  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  39.57 
 
 		 577 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0596  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  40.71 
 
 		 577 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0772523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7222  hypothetical protein  35.06 
 
 		 514 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0191551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0590  MORN repeat-containing protein  40.71 
 
 		 603 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00845  hypothetical protein  36.99 
 
 		 361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210026  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06082  hypothetical protein  36.99 
 
 		 361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3811  MORN repeat-containing protein  40.45 
 
 		 577 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0551  MORN domain-containing protein  40.27 
 
 		 642 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0733  MORN repeat family protein  40.25 
 
 		 575 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0236191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11900  hypothetical protein  38.43 
 
 		 579 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.55763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1093  hypothetical protein  38.43 
 
 		 579 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0634  MORN motif-containing protein  39.66 
 
 		 575 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4983  hypothetical protein  35.21 
 
 		 575 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7823  Peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  45.39 
 
 		 271 aa  123  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3361  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  29.9 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>