38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1506 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  92.91 
 
 		 141 aa  269  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  55.71 
 
 		 141 aa  170  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  57.25 
 
 		 146 aa  161  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  57.25 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  43.48 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  39.83 
 
 		 146 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  37.78 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  36.3 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  37.59 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  35.17 
 
 		 143 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  35.17 
 
 		 143 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  32.61 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  32.58 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  33.1 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  32.46 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.11 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.09 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  30.63 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.71 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  28.12 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  33.04 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  28.46 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.52 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  25.64 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  29.08 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  27.1 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.4 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.76 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  23.58 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.26 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.44 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  24.55 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.41 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  27 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>