15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_13459 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_13459  predicted protein  100 
 
 		 260 aa  530  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0504572  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5512  predicted protein  34.12 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.640864 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06560  t-SNARE, putative  31.4 
 
 		 409 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.155233  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02048  SNARE complex subunit (Tlg2), putative (Eurofung)  31.23 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000241869  normal  0.351676 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58577  predicted protein  28.03 
 
 		 358 aa  94  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0646976  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53649  predicted protein  36.78 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.831929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39509  predicted protein  38.2 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.336324 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04416  conserved hypothetical protein, Syntaxin-like (Eurofung)  39.74 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.570807 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09526  Putative ER-Golgi SNARE complex subunit Sed5 (Eurofung)  30.34 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_27950  predicted protein  22.81 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90189  SNARE protein SED5/Syntaxin 5  28.35 
 
 		 332 aa  49.3  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0309311  normal  0.0779886 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03350  integral membrane protein sed5, putative  33 
 
 		 364 aa  48.9  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0595382  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19932  predicted protein  25.29 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02560  syntaxin, putative  29.21 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01520  t-SNARE, putative  30.67 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.151238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>