More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_55086 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_55086  delta l-pyrroline-5-carboxylate synthetase  100 
 
 		 747 aa  1519    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18027  predicted protein  65.99 
 
 		 706 aa  880    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_1184  predicted protein  54.19 
 
 		 420 aa  428  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.730647 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2590  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.51 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2022  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.17 
 
 		 434 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2048  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.94 
 
 		 434 aa  359  9e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18451  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 		 438 aa  354  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2275  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  45.16 
 
 		 431 aa  348  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0718764  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4304  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.14 
 
 		 433 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal  0.487734 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10601  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.45 
 
 		 434 aa  345  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.107286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1397  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.08 
 
 		 435 aa  344  4e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0057  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.16 
 
 		 438 aa  343  5e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.944563  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0262  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.11 
 
 		 431 aa  343  9e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000913374  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90997  predicted protein  42.59 
 
 		 443 aa  342  2e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0590  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.11 
 
 		 436 aa  340  8e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.291608  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2209  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.57 
 
 		 445 aa  336  1e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0927  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.99 
 
 		 441 aa  333  1e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1026  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.91 
 
 		 435 aa  332  2e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.993795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06551  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.57 
 
 		 436 aa  332  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.555624  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1371  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.21 
 
 		 443 aa  331  3e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0026  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.04 
 
 		 438 aa  331  3e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.938682  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3394  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.06 
 
 		 443 aa  330  4e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06161  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.89 
 
 		 436 aa  330  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06461  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.82 
 
 		 438 aa  330  6e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2594  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.6 
 
 		 432 aa  329  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0557  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.37 
 
 		 432 aa  327  5e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588024  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2416  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.24 
 
 		 449 aa  320  5e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00821851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2013  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.86 
 
 		 431 aa  319  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0170243  normal  0.240578 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2265  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.1 
 
 		 431 aa  318  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19350  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  43.68 
 
 		 427 aa  318  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000458015 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06461  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.32 
 
 		 436 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.95 
 
 		 447 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.700906 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05799  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  42.51 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.22549  hitchhiker  0.00000000000409555 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06240  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase, putative  41.69 
 
 		 460 aa  300  5e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.08 
 
 		 446 aa  278  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.73 
 
 		 416 aa  277  5e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0634  gamma-glutamyl phosphate reductase  38 
 
 		 407 aa  275  3e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.39 
 
 		 418 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1319  gamma-glutamyl phosphate reductase  37.13 
 
 		 407 aa  270  5e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.81 
 
 		 410 aa  269  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.16 
 
 		 427 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  38.04 
 
 		 423 aa  269  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.46 
 
 		 411 aa  267  4e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  34.9 
 
 		 422 aa  267  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.74 
 
 		 423 aa  266  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.02 
 
 		 434 aa  266  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  37.37 
 
 		 418 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  35.37 
 
 		 418 aa  266  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.54 
 
 		 427 aa  265  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.26 
 
 		 418 aa  265  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.66 
 
 		 416 aa  263  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.52 
 
 		 430 aa  263  8e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  37.62 
 
 		 419 aa  263  8e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.73 
 
 		 421 aa  263  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0431  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.38 
 
 		 448 aa  263  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.74 
 
 		 421 aa  263  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  36.39 
 
 		 418 aa  263  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.29 
 
 		 421 aa  262  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.03 
 
 		 429 aa  262  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  35.85 
 
 		 418 aa  261  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  36.2 
 
 		 414 aa  261  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  36.14 
 
 		 418 aa  261  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.13 
 
 		 421 aa  261  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.65 
 
 		 423 aa  260  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0293  gamma-glutamyl phosphate reductase  36.73 
 
 		 433 aa  259  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00187024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  38.52 
 
 		 428 aa  259  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  35.78 
 
 		 418 aa  259  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  36.23 
 
 		 418 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.02 
 
 		 420 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.41 
 
 		 458 aa  258  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.26 
 
 		 418 aa  258  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.41 
 
 		 423 aa  258  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.41 
 
 		 458 aa  258  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.41 
 
 		 458 aa  258  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.41 
 
 		 458 aa  258  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.41 
 
 		 458 aa  258  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  35.71 
 
 		 418 aa  257  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  37.1 
 
 		 432 aa  258  4e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.57 
 
 		 418 aa  257  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0321  gamma-glutamyl phosphate reductase  37.53 
 
 		 435 aa  257  6e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  36.82 
 
 		 417 aa  257  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  37.53 
 
 		 416 aa  256  8e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.01 
 
 		 414 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.37 
 
 		 429 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.74 
 
 		 423 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4145  gamma-glutamyl phosphate reductase  37.02 
 
 		 413 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  37.5 
 
 		 427 aa  255  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  37.25 
 
 		 417 aa  254  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  35.82 
 
 		 418 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.71 
 
 		 421 aa  254  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  35.98 
 
 		 414 aa  254  6e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.02 
 
 		 418 aa  254  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2141  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.2 
 
 		 459 aa  254  6e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0319  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.59 
 
 		 412 aa  254  6e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.41 
 
 		 418 aa  253  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.67 
 
 		 424 aa  253  9.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.18 
 
 		 424 aa  253  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.54 
 
 		 418 aa  253  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0322  gamma-glutamyl phosphate reductase  36.43 
 
 		 433 aa  253  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.85 
 
 		 417 aa  253  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.257421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>