More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19350 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_19350  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
427 aa  870    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000458015 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2594  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.61 
 
 
432 aa  482  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0262  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.82 
 
 
431 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000913374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2013  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.35 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0170243  normal  0.240578 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0557  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.84 
 
 
432 aa  441  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588024  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2022  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
434 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4304  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.94 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal  0.487734 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2048  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
434 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2590  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 
434 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0927  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.98 
 
 
441 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1397  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.83 
 
 
435 aa  435  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1026  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.5 
 
 
435 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.993795  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18451  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.3 
 
 
438 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0057  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.23 
 
 
438 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.944563  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.89 
 
 
447 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10601  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.95 
 
 
434 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.107286  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2416  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.54 
 
 
449 aa  422  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00821851  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0026  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.17 
 
 
438 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.938682  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06461  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.69 
 
 
438 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2265  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.32 
 
 
431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3394  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 
443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321961  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1371  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 
443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2209  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.4 
 
 
445 aa  404  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2275  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.54 
 
 
431 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0718764  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90997  predicted protein  50 
 
 
443 aa  403  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06551  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.82 
 
 
436 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.555624  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0590  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.32 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.291608  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06161  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.56 
 
 
436 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06461  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.08 
 
 
436 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05799  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  46.58 
 
 
456 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.22549  hitchhiker  0.00000000000409555 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.2 
 
 
418 aa  364  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.86 
 
 
418 aa  345  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.1 
 
 
434 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.89 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.29 
 
 
417 aa  339  5.9999999999999996e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.9 
 
 
415 aa  338  9e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.05 
 
 
419 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06240  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase, putative  41.23 
 
 
460 aa  335  7.999999999999999e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.56 
 
 
417 aa  335  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.3 
 
 
427 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  44.56 
 
 
417 aa  335  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  42.2 
 
 
428 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.39 
 
 
418 aa  333  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.47 
 
 
421 aa  332  6e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.05 
 
 
417 aa  332  8e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.7 
 
 
416 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.81 
 
 
415 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.89 
 
 
421 aa  332  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.3 
 
 
429 aa  331  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.2 
 
 
416 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.05 
 
 
417 aa  331  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.95 
 
 
416 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.9 
 
 
418 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.75 
 
 
421 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.73 
 
 
421 aa  330  3e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.42 
 
 
416 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.4 
 
 
418 aa  329  4e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.75 
 
 
421 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.34 
 
 
420 aa  329  7e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.09 
 
 
419 aa  328  9e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.46 
 
 
416 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.39 
 
 
422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.46 
 
 
415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_1184  predicted protein  44.03 
 
 
420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.730647 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.47 
 
 
417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0257  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.53 
 
 
425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0240  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.47 
 
 
417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.78 
 
 
418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.47 
 
 
417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.48 
 
 
421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.47 
 
 
417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.57 
 
 
429 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_55086  delta l-pyrroline-5-carboxylate synthetase  43.68 
 
 
747 aa  327  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.44 
 
 
430 aa  327  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0275  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.47 
 
 
417 aa  327  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0870327  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.09 
 
 
418 aa  327  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0270  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.47 
 
 
417 aa  327  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.82 
 
 
418 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.47 
 
 
417 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.95 
 
 
418 aa  326  4.0000000000000003e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.5 
 
 
423 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.19 
 
 
435 aa  325  9e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  42 
 
 
423 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.4 
 
 
418 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.75 
 
 
423 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  38.93 
 
 
418 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.2 
 
 
413 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.75 
 
 
423 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.54 
 
 
417 aa  323  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.4 
 
 
419 aa  322  7e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.46 
 
 
415 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.26 
 
 
411 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.56 
 
 
426 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.27 
 
 
418 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.55 
 
 
423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  39.39 
 
 
418 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.22 
 
 
426 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  40.49 
 
 
419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.83 
 
 
421 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3751  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.65 
 
 
430 aa  320  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.634786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>