89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41409 on replicon NC_011698
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  100 
 
 
1506 aa  3107    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  31.61 
 
 
405 aa  169  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  30.74 
 
 
430 aa  164  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147664  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  30.46 
 
 
419 aa  149  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  28.92 
 
 
410 aa  149  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32292  predicted protein  28.06 
 
 
502 aa  148  8.000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1758  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  29.54 
 
 
407 aa  143  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.819467 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  29.24 
 
 
413 aa  141  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  28.29 
 
 
419 aa  140  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  26.71 
 
 
414 aa  139  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  29.46 
 
 
406 aa  139  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  30.49 
 
 
420 aa  139  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  26.32 
 
 
414 aa  138  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  27.87 
 
 
410 aa  138  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  29.37 
 
 
409 aa  138  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  28.96 
 
 
408 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1467  saccharopine dehydrogenase  27.15 
 
 
413 aa  136  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.071229  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  29.57 
 
 
419 aa  135  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2873  saccharopine dehydrogenase  28.6 
 
 
404 aa  135  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  28.31 
 
 
432 aa  134  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5681  saccharopine dehydrogenase  27.29 
 
 
416 aa  131  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6045  saccharopine dehydrogenase  27.29 
 
 
416 aa  131  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6531  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  27.29 
 
 
416 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  0.0830191 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  30.02 
 
 
418 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  29.57 
 
 
419 aa  131  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  29.57 
 
 
419 aa  131  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  27.72 
 
 
432 aa  130  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3953  saccharopine dehydrogenase  30.21 
 
 
421 aa  130  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0682928  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6092  saccharopine dehydrogenase  27.84 
 
 
419 aa  127  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207649  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7476  putative saccharopine dehydrogenase  26.33 
 
 
414 aa  126  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  26.89 
 
 
419 aa  126  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0383643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  28.76 
 
 
392 aa  125  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  28.25 
 
 
398 aa  125  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  28.76 
 
 
394 aa  124  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  29.66 
 
 
421 aa  124  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2468  saccharopine dehydrogenase  26.47 
 
 
392 aa  122  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  28.25 
 
 
394 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  28.22 
 
 
422 aa  121  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  26.2 
 
 
422 aa  120  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  28.09 
 
 
404 aa  119  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1410  saccharopine dehydrogenase  26.32 
 
 
393 aa  119  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  29.48 
 
 
377 aa  119  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  27.25 
 
 
390 aa  116  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0761  saccharopine dehydrogenase  30.07 
 
 
390 aa  115  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.092015  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  28.86 
 
 
389 aa  114  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  26.81 
 
 
388 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3639  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  28.54 
 
 
389 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  30.59 
 
 
388 aa  110  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  29.24 
 
 
389 aa  110  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  27.66 
 
 
390 aa  110  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  27.73 
 
 
386 aa  109  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  28.51 
 
 
391 aa  108  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03750  conserved hypothetical protein  27 
 
 
427 aa  108  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42770  predicted protein  44.35 
 
 
1086 aa  104  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  28.87 
 
 
391 aa  103  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  31.9 
 
 
430 aa  104  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45894  predicted protein  46.32 
 
 
354 aa  102  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3008  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  32.34 
 
 
402 aa  95.1  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.762164  normal  0.0490762 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43692  predicted protein  45.26 
 
 
117 aa  89  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45710  predicted protein  35.46 
 
 
890 aa  84  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.262092  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47243  predicted protein  37.72 
 
 
850 aa  82.8  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24929  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89710  predicted protein  25.78 
 
 
436 aa  70.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.332936 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  32.47 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  23.08 
 
 
382 aa  67  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  31.33 
 
 
324 aa  65.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  31.01 
 
 
351 aa  64.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  30.52 
 
 
345 aa  64.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  30.49 
 
 
350 aa  63.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  28.36 
 
 
352 aa  63.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  26.51 
 
 
363 aa  62.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  22.28 
 
 
498 aa  62.4  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  28.36 
 
 
352 aa  62.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  25.16 
 
 
376 aa  62.4  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  27.03 
 
 
376 aa  59.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  25.64 
 
 
378 aa  58.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  29.76 
 
 
348 aa  58.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  25.87 
 
 
353 aa  58.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  29.87 
 
 
351 aa  58.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  29.87 
 
 
351 aa  58.2  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  26.54 
 
 
368 aa  57.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  26.22 
 
 
355 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  27.27 
 
 
343 aa  53.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  25.56 
 
 
413 aa  50.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  26.26 
 
 
340 aa  50.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  24.83 
 
 
371 aa  50.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  40.91 
 
 
376 aa  49.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  23.81 
 
 
361 aa  48.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  22.39 
 
 
371 aa  48.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4494  saccharopine dehydrogenase  22.93 
 
 
343 aa  47.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>