54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41079 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_41079  predicted protein  100 
 
 		 243 aa  510  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5392  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.82 
 
 		 227 aa  148  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1005  anti-ECFsigma factor, ChrR  41.38 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000085079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3840  anti-ECFsigma factor, ChrR  41.59 
 
 		 224 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2083  anti-ECFsigma factor, ChrR  40.61 
 
 		 222 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.246255  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0586  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.51 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0869  anti-sigm factor, ChrR  40.27 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0948086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0423  anti-ECFsigma factor, ChrR  40.44 
 
 		 222 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0840  anti-sigma factor, ChrR  40.52 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4157  anti-sigm factor, ChrR  39.65 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.424525 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1906  anti-ECFsigma factor, ChrR  40.76 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1782  anti-ECFsigma factor, ChrR  40.44 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336195  normal  0.05616 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1793  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.376612  normal  0.0711079 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0982  hypothetical protein  38.39 
 
 		 223 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6152  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.65 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1969  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.74 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0025  transcriptional activator anti-ECFsigma factor  38.67 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322497  normal  0.142099 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1332  anti-ECFsigma factor, ChrR  38.08 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.469882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4129  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.64 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0881  hypothetical protein  42.08 
 
 		 192 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0707525  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6445  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.89 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3233  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.78 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.741075  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00891  hypothetical protein  37.44 
 
 		 226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4247  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.23 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1575  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.22 
 
 		 220 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1180  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.76 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000607  hypothetical protein  34.55 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000379555  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1373  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.59 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86738  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02219  predicted transcription negative regulator  32.46 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.279228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0852  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.85 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0821  hypothetical protein  33.18 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1225  anti-sigm factor, ChrR  34.22 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3618  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.6 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0730754  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1495  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.99 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3481  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.04 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0893  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.47 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1362  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.9 
 
 		 218 aa  92.4  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0881  anti-ECFsigma factor, ChrR  40.91 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0858  anti-ECFsigma factor, ChrR  40.91 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0451  anti-ECFsigma factor, ChrR  28.81 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38082 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1946  anti-ECFsigma factor, ChrR  32 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00378013  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5650  Allophanate hydrolase  33.33 
 
 		 114 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0555941  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4481  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.85 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6449  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.92 
 
 		 117 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0335897 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1968  anti-Sigm factor, ChrR  30.47 
 
 		 150 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.603561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3608  anti-Sigm factor, ChrR  32.93 
 
 		 132 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1059  hypothetical protein  38.1 
 
 		 151 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4076  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.27 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1630  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.85 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0768  hypothetical protein  31.65 
 
 		 159 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1454  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.03 
 
 		 125 aa  42.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2037  anti-ECFsigma factor, ChrR  35.06 
 
 		 262 aa  42  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.280175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03283  hypothetical protein  33.9 
 
 		 219 aa  42  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1378  putative transcriptional activator  30.3 
 
 		 228 aa  42  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>