28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_2527 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_2527  predicted protein  100 
 
 
333 aa  689    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23532  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28778  predicted protein  34.3 
 
 
318 aa  175  9e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00481589  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85276  predicted protein  26.19 
 
 
507 aa  113  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00910  tbc1 domain family protein, putative  27.14 
 
 
598 aa  106  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07444  GTPase activating protein (Gyp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06080)  27.01 
 
 
523 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000566047  normal  0.90636 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12157  predicted protein  25.51 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02160  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 
860 aa  90.1  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04537  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02840)  27.92 
 
 
684 aa  73.6  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236302  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00320  Rab GTPase activator, putative  25.88 
 
 
897 aa  68.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0237243  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5426  predicted protein  26.02 
 
 
230 aa  65.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0224644  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06618  GTPase activating protein (Gyp7), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03940)  24.62 
 
 
817 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.472998 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84608  GTPase activating protein  24.68 
 
 
774 aa  59.7  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.323048 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_15898  predicted protein  27.41 
 
 
674 aa  57  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.062814  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05407  GTPase activating protein (Evi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13850)  22.39 
 
 
872 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0970928 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_55114  predicted protein  23.41 
 
 
617 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.950731  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90139  predicted protein  23.28 
 
 
510 aa  53.9  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.405101  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10479  predicted protein  21.18 
 
 
300 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00281  mitotic check point protein (Bub2), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02940)  26.54 
 
 
453 aa  52.8  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.558287  normal  0.0195499 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02790  expressed protein  30.77 
 
 
393 aa  52.8  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01110  conserved hypothetical protein  24.85 
 
 
1051 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01000  conserved hypothetical protein  25.63 
 
 
644 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00740  mitotic check point protein bub2, putative  25.31 
 
 
286 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26794  predicted protein  25.37 
 
 
423 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649939  normal  0.0260898 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30730  predicted protein  29.9 
 
 
420 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01980  GTPase activating protein (Gyp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10600)  22.22 
 
 
883 aa  46.2  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0011064 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16235  predicted protein  25.3 
 
 
440 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03750  conserved hypothetical protein  22.22 
 
 
742 aa  43.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85359  predicted protein  22.89 
 
 
641 aa  42.4  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0278738  normal  0.155514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>