36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0042 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0042  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 383 aa  798    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2105  polysaccharide biosynthesis protein  58.94 
 
 		 363 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  50.84 
 
 		 955 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  52.59 
 
 		 377 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  49.16 
 
 		 1077 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3246  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  48.5 
 
 		 358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2346  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  50.56 
 
 		 368 aa  354  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  46.37 
 
 		 787 aa  345  8e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1508  hypothetical protein  47.14 
 
 		 381 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  46.54 
 
 		 686 aa  336  3.9999999999999995e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  46.89 
 
 		 734 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.62 
 
 		 734 aa  332  8e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  46.91 
 
 		 695 aa  330  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  44.6 
 
 		 1082 aa  326  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0298  hypothetical protein  46.24 
 
 		 358 aa  319  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0319  hypothetical protein  45.4 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0334  hypothetical protein  45.13 
 
 		 358 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  44.35 
 
 		 1247 aa  310  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0304  hypothetical protein  44.85 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0253  hypothetical protein  45.13 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  43.82 
 
 		 843 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.71 
 
 		 957 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0700  hypothetical protein  42.94 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1198  WbwX  39.4 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.696944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0273  hypothetical protein  43.77 
 
 		 317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0259  hypothetical protein  43.77 
 
 		 317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  41.57 
 
 		 751 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  41.57 
 
 		 751 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2554  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  37.43 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 		 882 aa  259  6e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  40.28 
 
 		 357 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1412  tetratricopeptide TPR_2  32.96 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2508  hypothetical protein  24.56 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000156846  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2521  hypothetical protein  24.56 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540402  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4007  polysaccharide biosynthesis protein  73.91 
 
 		 47 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  24.06 
 
 		 576 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>