More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0011 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0559  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  45.11 
 
 		 870 aa  697    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  50.85 
 
 		 824 aa  792    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  48.41 
 
 		 812 aa  753    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3316  chaperone-associated ATPase, putative  45.16 
 
 		 940 aa  650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  52.81 
 
 		 834 aa  834    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2036  AAA family ATPase  41.9 
 
 		 832 aa  650    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  51.35 
 
 		 817 aa  815    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  51.41 
 
 		 848 aa  805    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.06 
 
 		 811 aa  784    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  62.61 
 
 		 824 aa  1035    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  50.43 
 
 		 811 aa  786    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2156  ATPase  48.78 
 
 		 848 aa  664    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  60.09 
 
 		 843 aa  1007    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.06 
 
 		 811 aa  784    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  50.06 
 
 		 811 aa  784    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  50.06 
 
 		 811 aa  785    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  52.21 
 
 		 844 aa  830    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  61.67 
 
 		 841 aa  1030    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0564  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  46.5 
 
 		 932 aa  678    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  58.48 
 
 		 859 aa  967    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  50.68 
 
 		 818 aa  813    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  52.02 
 
 		 830 aa  845    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5916  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  44.53 
 
 		 942 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0630  ATPase  47.12 
 
 		 890 aa  709    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.841599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  51.52 
 
 		 840 aa  843    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  62.82 
 
 		 823 aa  1045    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  64.81 
 
 		 814 aa  1058    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0726  ATPase  50.93 
 
 		 820 aa  762    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4466  ATPase  45.92 
 
 		 964 aa  664    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0312  ATPase AAA-2  54.1 
 
 		 803 aa  691    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6998  putative ClpA/B protease, ATPase subunit  45.87 
 
 		 949 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29402  chaperone, Hsp100 family, ClpC-type  56.35 
 
 		 840 aa  906    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0120883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1932  ATPase  46.82 
 
 		 847 aa  746    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.356612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  57.81 
 
 		 843 aa  942    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1484  ATPase  44.55 
 
 		 863 aa  688    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  60.74 
 
 		 846 aa  1005    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3413  ATPase  44.88 
 
 		 949 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  52.33 
 
 		 812 aa  843    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.06 
 
 		 811 aa  784    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  60.83 
 
 		 842 aa  1026    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  62.8 
 
 		 824 aa  1024    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2583  ATPase  43.9 
 
 		 848 aa  708    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.444308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1731  ATPase  47.96 
 
 		 845 aa  765    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  51.09 
 
 		 840 aa  776    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2370  ATPase  45.07 
 
 		 947 aa  649    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0304669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  52.56 
 
 		 834 aa  832    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46264  chaperone, Hsp100 family, ClpC-type  49.14 
 
 		 781 aa  689    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.335284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4070  ATPase  50.25 
 
 		 825 aa  790    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  51.54 
 
 		 851 aa  819    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1170  ATPase AAA-2  45.66 
 
 		 949 aa  657    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.501064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  52.35 
 
 		 818 aa  838    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1200  ATPase  49.4 
 
 		 825 aa  789    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0973112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1887  putative ATP-dependent Clp protease, ATP- binding subunit  44.28 
 
 		 961 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135075  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2016  ATPase  48.15 
 
 		 847 aa  765    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.551696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0024  ATPase  49.33 
 
 		 818 aa  751    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000951044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3573  ATPase AAA-2  46.52 
 
 		 818 aa  706    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2308  ATPase  48.52 
 
 		 848 aa  664    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  48.18 
 
 		 792 aa  732    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1406  ATPase AAA-2  45.5 
 
 		 946 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1494  ATPase  46.62 
 
 		 830 aa  730    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000400156  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  50.74 
 
 		 847 aa  803    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  49.02 
 
 		 837 aa  714    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  48.38 
 
 		 886 aa  698    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  50.84 
 
 		 834 aa  820    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  60.24 
 
 		 842 aa  1011    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1079  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  45.05 
 
 		 848 aa  715    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  46.43 
 
 		 814 aa  729    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  46.37 
 
 		 814 aa  727    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  63.15 
 
 		 825 aa  1038    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  62.18 
 
 		 825 aa  1027    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0413  ATPase  47.58 
 
 		 789 aa  729    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  52.18 
 
 		 828 aa  806    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1392  ATPase  48.83 
 
 		 791 aa  741    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5668  ATPase  44.63 
 
 		 953 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06000  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  46.87 
 
 		 850 aa  685    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0160864 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  52.21 
 
 		 844 aa  830    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0666  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  43.34 
 
 		 816 aa  644    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.483496  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0514  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  45.96 
 
 		 823 aa  713    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.262133  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0597  ATPase  45.96 
 
 		 733 aa  674    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.139339  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0283  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  44.85 
 
 		 838 aa  711    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.114568  hitchhiker  0.0000140649 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  49.03 
 
 		 822 aa  775    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0185  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  46.6 
 
 		 826 aa  685    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3573  chaperone endopeptidase Clp ATP-binding chain B,ClpB  46.2 
 
 		 820 aa  640    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3321  ATPase  46.06 
 
 		 935 aa  635    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  52.21 
 
 		 836 aa  830    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  52.32 
 
 		 830 aa  843    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3818  ATPase  45.7 
 
 		 857 aa  646    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  50.68 
 
 		 818 aa  813    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6423  ATPase  45.5 
 
 		 946 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.707526  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  52.7 
 
 		 839 aa  852    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  46.16 
 
 		 854 aa  738    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4012  ATPase  46.45 
 
 		 953 aa  658    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  51.85 
 
 		 861 aa  822    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  50.74 
 
 		 847 aa  803    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0310  ATPase  45.34 
 
 		 741 aa  659    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000412877  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  50.56 
 
 		 847 aa  812    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3393  ATPase  44.5 
 
 		 949 aa  651    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246292  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  50.49 
 
 		 847 aa  800    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  50.37 
 
 		 847 aa  813    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1220  ATPase  47.43 
 
 		 812 aa  741    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>