More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0011 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1436  ATPase AAA-2 domain protein  49.52 
 
 
834 aa  773  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.327817 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0255  ATPase AAA-2 domain protein  47.5 
 
 
849 aa  744  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  47.8 
 
 
814 aa  729  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  50.55 
 
 
814 aa  828  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6193  ATPase AAA-2 domain protein  44.79 
 
 
930 aa  642  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809707  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5492  ATPase AAA-2 domain protein  44.16 
 
 
944 aa  644  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.311641  normal  0.315903 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0059  ATPase AAA-2 domain protein  46.99 
 
 
860 aa  743  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310475  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1526  ATPase  46.53 
 
 
839 aa  745  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00101266  unclonable  2.18976e-18 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5495  ATPase  46.68 
 
 
902 aa  679  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2678  ATPase  48.04 
 
 
840 aa  740  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6417  ATPase  44.88 
 
 
953 aa  641  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.243039 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7086  ATPase  45.5 
 
 
946 aa  645  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355216  normal  0.126483 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  49.08 
 
 
791 aa  749  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0750  ATPase  51.3 
 
 
820 aa  768  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0092536  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  48.54 
 
 
792 aa  733  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  51.52 
 
 
869 aa  827  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0355  ATPase AAA-2 domain protein  46.39 
 
 
853 aa  736  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  7.16084e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  51.19 
 
 
826 aa  803  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.06 
 
 
811 aa  784  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.42 
 
 
811 aa  786  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.55448e-05  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  63.25 
 
 
821 aa  1030  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0011  ATPase AAA-2 domain protein  100 
 
 
792 aa  1598  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  63.59 
 
 
822 aa  1024  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0025  ATPase AAA-2 domain protein  71.41 
 
 
789 aa  1139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.06 
 
 
811 aa  785  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  50.31 
 
 
823 aa  790  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0899  ATPase AAA-2 domain protein  46.79 
 
 
894 aa  704  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  4.1024e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  50.06 
 
 
811 aa  784  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  47.43 
 
 
813 aa  703  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2617  ATPase AAA-2 domain protein  45.94 
 
 
846 aa  724  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0330  ATPase AAA-2 domain protein  46.99 
 
 
849 aa  749  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.711717 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  52.28 
 
 
812 aa  828  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  53.83 
 
 
816 aa  847  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  49.94 
 
 
811 aa  784  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3321  ATPase  46.06 
 
 
935 aa  635  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0630  ATPase  47.12 
 
 
890 aa  709  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.841599  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  50.43 
 
 
811 aa  786  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4466  ATPase  45.92 
 
 
964 aa  664  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  51.52 
 
 
840 aa  843  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  51.54 
 
 
851 aa  819  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0564  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  46.5 
 
 
932 aa  678  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  50.68 
 
 
818 aa  813  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0597  ATPase  45.96 
 
 
733 aa  674  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.139339  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0413  ATPase  47.58 
 
 
789 aa  729  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0024  ATPase  49.33 
 
 
818 aa  751  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  9.51044e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  51.41 
 
 
848 aa  805  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4070  ATPase  50.25 
 
 
825 aa  790  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1731  ATPase  47.96 
 
 
845 aa  765  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0310  ATPase  45.34 
 
 
741 aa  659  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  4.12877e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  49.03 
 
 
822 aa  775  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5411  ATPase  45.9 
 
 
953 aa  668  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0379558 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1629  ATPase  43.83 
 
 
826 aa  675  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0363  ATPase  47.14 
 
 
830 aa  731  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0571642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  48.77 
 
 
824 aa  763  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  56.26 
 
 
859 aa  951  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0503  ATPase  49.64 
 
 
837 aa  733  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0028  ATPase  50.37 
 
 
822 aa  781  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  52.21 
 
 
844 aa  830  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2308  ATPase  48.52 
 
 
848 aa  664  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  52.21 
 
 
836 aa  830  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  52.81 
 
 
834 aa  834  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3573  chaperone endopeptidase Clp ATP-binding chain B,ClpB  46.2 
 
 
820 aa  640  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2016  ATPase  48.15 
 
 
847 aa  765  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.551696  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1200  ATPase  49.4 
 
 
825 aa  789  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0973112  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1494  ATPase  46.62 
 
 
830 aa  730  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  4.00156e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1850  ATPase AAA-2 domain protein  48.54 
 
 
826 aa  754  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  62.61 
 
 
824 aa  1035  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1370  ATPase AAA-2 domain protein  45.71 
 
 
843 aa  731  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79218  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  51.9 
 
 
862 aa  833  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  53.37 
 
 
835 aa  863  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_56  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  50.85 
 
 
824 aa  796  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1194  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  48.16 
 
 
812 aa  747  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.453766  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  52.32 
 
 
852 aa  835  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  46.79 
 
 
815 aa  731  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  50.24 
 
 
820 aa  791  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  49.69 
 
 
819 aa  759  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  52.14 
 
 
858 aa  833  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  52.08 
 
 
837 aa  846  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2966  ATPase AAA-2 domain protein  47.38 
 
 
842 aa  688  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00321823  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1343  ATPase AAA-2 domain protein  48 
 
 
850 aa  754  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  51.84 
 
 
848 aa  837  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  51.83 
 
 
868 aa  813  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  52.14 
 
 
841 aa  848  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  63.39 
 
 
815 aa  1031  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11148  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  44.23 
 
 
848 aa  700  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2175  ATPase AAA-2 domain protein  45.92 
 
 
734 aa  640  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  52.13 
 
 
836 aa  847  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1369  ATPase AAA-2 domain protein  49.6 
 
 
830 aa  712  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  53.06 
 
 
834 aa  861  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3203  ATPase AAA-2 domain protein  45.81 
 
 
853 aa  675  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  51.65 
 
 
855 aa  839  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  51.6 
 
 
858 aa  813  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0861  ATPase AAA-2 domain protein  47.85 
 
 
828 aa  715  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00086929  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0603  ATPase AAA-2 domain protein  45.41 
 
 
852 aa  729  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0740742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  51.65 
 
 
854 aa  831  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3836  ATPase AAA-2 domain-containing protein  46.84 
 
 
825 aa  659  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493394  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2062  ATPase AAA-2 domain protein  47.3 
 
 
847 aa  675  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.587119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  51.33 
 
 
810 aa  830  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  52.4 
 
 
812 aa  808  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  50.92 
 
 
846 aa  834  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>