26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00850 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0143  hypothetical protein  96.74 
 
 
399 aa  641  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00850  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  766  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0095739  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2311  hypothetical protein  65.41 
 
 
397 aa  453  1e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  hitchhiker  2.74996e-05 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1318  protein of unknown function DUF214  46.25 
 
 
427 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0465  protein of unknown function DUF214  39.9 
 
 
410 aa  253  5e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4234  hypothetical protein  38.4 
 
 
410 aa  235  1e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.496459  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52020  permease protein of ABC transporter  40.6 
 
 
407 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2876  ABC transporter, permease protein, putative  39.05 
 
 
407 aa  217  3e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2627  hypothetical protein  39.01 
 
 
407 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124636  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3221  protein of unknown function DUF214  36.77 
 
 
395 aa  173  4e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.612368  normal  0.761835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1840  hypothetical protein  40.76 
 
 
408 aa  169  8e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3421  ABC transporter related  38.12 
 
 
396 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.952582  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3149  hypothetical protein  31.93 
 
 
410 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.750768  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3869  hypothetical protein  36.91 
 
 
396 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000457394  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3132  hypothetical protein  38.06 
 
 
396 aa  129  1e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0592357  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4057  hypothetical protein  31.98 
 
 
399 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058101  normal  0.267304 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1668  protein of unknown function DUF214  36.53 
 
 
609 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0902  protein of unknown function DUF214  32.47 
 
 
399 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.082954  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1002  protein of unknown function DUF214  25.76 
 
 
700 aa  61.2  3e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.95364  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  25.95 
 
 
1090 aa  50.4  5e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  27.97 
 
 
414 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.97 
 
 
414 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 
422 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.24 
 
 
880 aa  44.3  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  28.27 
 
 
488 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  26.55 
 
 
422 aa  43.5  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.412712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>