31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_29961 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  100 
 
 
201 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  57.53 
 
 
223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2294  hypothetical protein  54.4 
 
 
216 aa  211  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  53.09 
 
 
217 aa  211  7e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2665  hypothetical protein  56.02 
 
 
195 aa  209  3e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.643893  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  52.58 
 
 
217 aa  208  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1791  hypothetical protein  38.14 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18891  dolichol kinase  37.11 
 
 
213 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19081  dolichol kinase  37.11 
 
 
213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  43.89 
 
 
232 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18891  hypothetical protein  39.31 
 
 
147 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  41.53 
 
 
225 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  42.93 
 
 
225 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  41.08 
 
 
235 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  39.77 
 
 
227 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  40.31 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  40.66 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  40.11 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  31.78 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  30.26 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  30.77 
 
 
234 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  29.93 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0746  protein of unknown function DUF92 transmembrane  24.26 
 
 
521 aa  52  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.213381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  27.14 
 
 
237 aa  51.6  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  27.44 
 
 
516 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  27.14 
 
 
237 aa  49.3  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35668  predicted protein  27.48 
 
 
251 aa  46.2  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.406511 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  29.17 
 
 
237 aa  45.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  25.91 
 
 
208 aa  45.1  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34441  predicted protein  27.92 
 
 
286 aa  42.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  27.14 
 
 
227 aa  41.2  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>