27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_05021 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_05021  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 
153 aa  317  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.170532  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05601  single-stranded DNA-binding protein  63.4 
 
 
145 aa  193  7e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0125633  normal  0.367261 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07371  single-stranded DNA-binding protein  58.18 
 
 
160 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1835  single-stranded DNA-binding protein  63.29 
 
 
145 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161636  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0687  hypothetical protein  55.56 
 
 
152 aa  180  6e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1671  hypothetical protein  54.76 
 
 
168 aa  174  5e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05661  single-stranded DNA-binding protein  50.98 
 
 
149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.621849  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05291  single-stranded DNA-binding protein  47.71 
 
 
141 aa  153  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05591  single-stranded DNA-binding protein  47.06 
 
 
141 aa  150  5e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0503  hypothetical protein  45.96 
 
 
141 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0079  hypothetical protein  40.26 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.998813  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1502  single-strand binding protein  42.22 
 
 
165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.440109  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2913  single-strand binding protein  44.44 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3208  single-strand binding protein  44.44 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2046  single-strand binding protein  34.81 
 
 
180 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377455  normal  0.610609 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3883  single-strand-binding protein  41.35 
 
 
181 aa  92  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3185  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  40 
 
 
168 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0138929  normal  0.0807912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0526  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  39.81 
 
 
219 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  24.36 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  26.83 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  25.81 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  24.84 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  22.29 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  30.91 
 
 
193 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  21.38 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  24.83 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  23.72 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>