19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2294 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2294  hypothetical protein  100 
 
 		 549 aa  1121    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2778  hypothetical protein  32.23 
 
 		 490 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000124034  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  26.51 
 
 		 486 aa  95.5  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  22.09 
 
 		 586 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  30.85 
 
 		 597 aa  66.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  26.35 
 
 		 515 aa  64.7  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0843  ATPase  24.15 
 
 		 602 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000396112  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0145  hypothetical protein  22.35 
 
 		 518 aa  57  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0155  AAA ATPase  27.32 
 
 		 544 aa  55.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.754147  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3178  putative ATP binding protein  26.37 
 
 		 496 aa  54.7  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.033124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5059  AAA ATPase  28.1 
 
 		 518 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.32918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  33.33 
 
 		 428 aa  47.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  29.17 
 
 		 459 aa  47  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4235  ATPase-like protein  36.23 
 
 		 187 aa  45.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  33.33 
 
 		 408 aa  45.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2370  AAA ATPase  21.1 
 
 		 454 aa  45.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  34.94 
 
 		 368 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  32.47 
 
 		 224 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  42.86 
 
 		 648 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>