31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0932 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0932  hypothetical protein  100 
 
 		 563 aa  1139    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0523701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3412  hypothetical protein  74.73 
 
 		 566 aa  823    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0768  hypothetical protein  59.13 
 
 		 563 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.8087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1361  hypothetical protein  53.16 
 
 		 568 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515582  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0865  hypothetical protein  53.14 
 
 		 564 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0948  hypothetical protein  50.6 
 
 		 571 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4538  hypothetical protein  51.86 
 
 		 540 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1306  hypothetical protein  32.15 
 
 		 617 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7239  hypothetical protein  38.41 
 
 		 528 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6052  hypothetical protein  37 
 
 		 546 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157473  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4284  conserved hypothetical proteinn  33.94 
 
 		 597 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3606  hypothetical protein  33.41 
 
 		 646 aa  211  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3898  hypothetical protein  33.17 
 
 		 647 aa  210  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6670  hypothetical protein  32.91 
 
 		 590 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0074  hypothetical protein  32.72 
 
 		 592 aa  204  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3589  hypothetical protein  31.43 
 
 		 552 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0075093 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4270  hypothetical protein  27.12 
 
 		 528 aa  140  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0072  hypothetical protein  26.4 
 
 		 512 aa  136  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387574  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0067  hypothetical protein  26.4 
 
 		 502 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2738  hypothetical protein  27.97 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.22803  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1905  hypothetical protein  28.03 
 
 		 423 aa  125  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3723  hypothetical protein  26.37 
 
 		 505 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2706  hypothetical protein  24.78 
 
 		 467 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4529  hypothetical protein  27.63 
 
 		 420 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1085  hypothetical protein  26.23 
 
 		 537 aa  96.3  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.016915  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3308  hypothetical protein  24.01 
 
 		 511 aa  93.6  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4817  hypothetical protein  23.44 
 
 		 424 aa  86.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1489  hypothetical protein  22.42 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3610  hypothetical protein  25.7 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0252  hypothetical protein  27.18 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05206  hypothetical protein  22.29 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>