20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0047 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0047  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  219  7e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.090381  normal  0.242113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0055  hypothetical protein  92.45 
 
 
106 aa  205  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0384  type IV pilus assembly PilZ  82.61 
 
 
108 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.892803  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0087  hypothetical protein  89.53 
 
 
101 aa  162  1e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423806  normal  0.428785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0626  hypothetical protein  70.19 
 
 
104 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.369246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0205  hypothetical protein  73.08 
 
 
104 aa  153  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0080  hypothetical protein  68.63 
 
 
102 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3800  hypothetical protein  62.5 
 
 
104 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0493  type IV pilus assembly PilZ  61.39 
 
 
109 aa  127  7e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0398  hypothetical protein  66.67 
 
 
105 aa  126  1e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0528  hypothetical protein  61.46 
 
 
107 aa  125  2e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1875  hypothetical protein  58.65 
 
 
104 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102054  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1495  hypothetical protein  60.82 
 
 
106 aa  119  1e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3854  hypothetical protein  58.76 
 
 
106 aa  118  2e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3041  hypothetical protein  65.12 
 
 
92 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2410  type IV pilus assembly PilZ  65.12 
 
 
91 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00616498  normal  0.0220666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4775  type IV pilus assembly PilZ  46.94 
 
 
103 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0542658  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  36.05 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  36.47 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2644  hypothetical protein  34.91 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>