81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0232 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 198 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.77 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.04 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4709  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.69 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.6 
 
 		 240 aa  121  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.6 
 
 		 240 aa  121  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.6 
 
 		 240 aa  121  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.25 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.88 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.45 
 
 		 295 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.32 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.46 
 
 		 147 aa  118  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  35.75 
 
 		 200 aa  114  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3967  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.71 
 
 		 246 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  40.54 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.73 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.73 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.73 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.73 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.3 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  40 
 
 		 262 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.16 
 
 		 241 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.91 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5312  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.22 
 
 		 232 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.85 
 
 		 234 aa  98.6  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.69 
 
 		 251 aa  98.2  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  34.75 
 
 		 289 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4318  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.73 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.531167  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  30.52 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  32.12 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.97 
 
 		 405 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 		 185 aa  92.8  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.78 
 
 		 469 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.49 
 
 		 390 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.92 
 
 		 306 aa  89  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  31.07 
 
 		 1027 aa  88.2  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  31.71 
 
 		 241 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4550  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.5 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0646  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5697  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.8 
 
 		 400 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5832  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.15 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3140  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.81 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0169757  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2945  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.46 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0435616  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.25 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.28 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  25.53 
 
 		 148 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.79 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.17 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4415  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.91 
 
 		 150 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.66 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  28.8 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.01 
 
 		 249 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.24 
 
 		 243 aa  48.9  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.14 
 
 		 147 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.81 
 
 		 154 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.38 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.82 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.29 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3913  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.74 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0164888  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  26.09 
 
 		 988 aa  45.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.19 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0569  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.88 
 
 		 148 aa  45.4  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0217411 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.9 
 
 		 155 aa  45.1  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  26.35 
 
 		 176 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.95 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.35 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.68 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  26.4 
 
 		 980 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.91 
 
 		 157 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.51 
 
 		 149 aa  43.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.77 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.94 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  23.81 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.85 
 
 		 220 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.15 
 
 		 153 aa  42.4  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  18.07 
 
 		 246 aa  41.6  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  28.37 
 
 		 983 aa  42  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  25.6 
 
 		 1012 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.62 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.32 
 
 		 151 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  23.39 
 
 		 232 aa  41.2  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>