More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0990 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0990  pyruvate kinase  100 
 
 		 492 aa  1014    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00681712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  42 
 
 		 584 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  41.25 
 
 		 479 aa  348  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  40.09 
 
 		 578 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  39.75 
 
 		 588 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  39.7 
 
 		 583 aa  338  9e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  38.95 
 
 		 582 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  37.89 
 
 		 585 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1040  pyruvate kinase  38.13 
 
 		 480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  38.69 
 
 		 596 aa  333  5e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  38.69 
 
 		 494 aa  332  8e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  39.11 
 
 		 597 aa  332  9e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  38.69 
 
 		 596 aa  332  9e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  36.71 
 
 		 580 aa  331  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  38.81 
 
 		 581 aa  330  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  38.9 
 
 		 587 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  39.58 
 
 		 472 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  39.24 
 
 		 478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  38.9 
 
 		 596 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  40.35 
 
 		 583 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  37.76 
 
 		 474 aa  326  6e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  37.39 
 
 		 583 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  39.57 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  39.15 
 
 		 586 aa  325  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  39.57 
 
 		 472 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  38.72 
 
 		 600 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  39.54 
 
 		 476 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  39.24 
 
 		 601 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  38.22 
 
 		 582 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  42.96 
 
 		 582 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  39.58 
 
 		 585 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  39.58 
 
 		 585 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  37.32 
 
 		 585 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  38.57 
 
 		 488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  37.53 
 
 		 585 aa  319  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  38.61 
 
 		 480 aa  319  9e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  37.45 
 
 		 483 aa  318  1e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  39.02 
 
 		 580 aa  318  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  38.35 
 
 		 590 aa  318  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  39.07 
 
 		 587 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  37.32 
 
 		 585 aa  317  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  37.97 
 
 		 471 aa  317  4e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  38.69 
 
 		 476 aa  317  4e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  37.76 
 
 		 585 aa  316  5e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  37.32 
 
 		 585 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  37.32 
 
 		 585 aa  316  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  37.32 
 
 		 585 aa  316  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  37.32 
 
 		 585 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  37.32 
 
 		 585 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  37.11 
 
 		 585 aa  316  7e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  37.11 
 
 		 585 aa  316  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  38.35 
 
 		 592 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  38.35 
 
 		 592 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  37.11 
 
 		 585 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  38.94 
 
 		 577 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  39.24 
 
 		 585 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1115  pyruvate kinase  40.63 
 
 		 490 aa  313  2.9999999999999996e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000141137  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  37 
 
 		 590 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  38.16 
 
 		 589 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  38 
 
 		 605 aa  312  7.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  37.37 
 
 		 594 aa  312  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  38.13 
 
 		 467 aa  312  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  38.13 
 
 		 467 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  36.79 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3378  pyruvate kinase  37.79 
 
 		 479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  37.26 
 
 		 479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  35.82 
 
 		 472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  36.58 
 
 		 478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  35.61 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  38.36 
 
 		 482 aa  307  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  37.45 
 
 		 470 aa  307  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  39.38 
 
 		 474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  36.36 
 
 		 485 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  39.87 
 
 		 471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  40.91 
 
 		 491 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  35.81 
 
 		 580 aa  306  7e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1716  pyruvate kinase  37.15 
 
 		 469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  38.61 
 
 		 477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  37 
 
 		 580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  36.42 
 
 		 479 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  37.1 
 
 		 471 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1850  pyruvate kinase  40.51 
 
 		 474 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  37.82 
 
 		 471 aa  303  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  37.23 
 
 		 474 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  37.23 
 
 		 477 aa  302  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  37.02 
 
 		 474 aa  302  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  41.01 
 
 		 509 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  38.05 
 
 		 474 aa  300  4e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  38.3 
 
 		 478 aa  299  9e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  36.61 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  38.78 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  37.15 
 
 		 476 aa  296  4e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  39.37 
 
 		 483 aa  296  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0609  pyruvate kinase  36.3 
 
 		 481 aa  295  9e-79  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.084312  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5100  pyruvate kinase  37.68 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  35.88 
 
 		 474 aa  294  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2244  pyruvate kinase  40.68 
 
 		 480 aa  293  4e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0168966 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1002  pyruvate kinase  36.6 
 
 		 477 aa  293  5e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  37.53 
 
 		 472 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  37.53 
 
 		 472 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>