More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1062 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  68.13 
 
 
457 aa  657    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  100 
 
 
469 aa  964    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  66 
 
 
457 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3299  phosphomannomutase  63.68 
 
 
458 aa  617  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  63.34 
 
 
462 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  62.91 
 
 
462 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2267  phosphomannomutase  62.88 
 
 
464 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434508  normal  0.220531 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0920  Phosphomannomutase  62.66 
 
 
464 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3701  phosphomannomutase  62.88 
 
 
464 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  62.96 
 
 
461 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  62.53 
 
 
461 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  61.66 
 
 
461 aa  597  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2497  phosphomannomutase  61.14 
 
 
485 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679752  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0745  phosphomannomutase  61.22 
 
 
461 aa  592  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  61.22 
 
 
461 aa  590  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  61.4 
 
 
465 aa  580  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3990  phosphomannomutase  62.01 
 
 
464 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.047705 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0863  phosphomannomutase  61.79 
 
 
464 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0414  phosphomannomutase  61.79 
 
 
489 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0893  phosphomannomutase  61.79 
 
 
489 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498123  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2191  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  62.23 
 
 
472 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3143  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  62.01 
 
 
464 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2064  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  62.23 
 
 
464 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.020226  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3083  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  62.23 
 
 
472 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3119  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  62.23 
 
 
472 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  62.23 
 
 
961 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2550  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  62.23 
 
 
464 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0783  phosphomannomutase  60.7 
 
 
464 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0772  phosphomannomutase  60.7 
 
 
487 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1489  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  61.57 
 
 
464 aa  567  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0374748  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  60 
 
 
868 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  60 
 
 
854 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  58.46 
 
 
465 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  58.02 
 
 
463 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  58.02 
 
 
466 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  57.68 
 
 
863 aa  552  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  58.28 
 
 
460 aa  551  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  57.58 
 
 
466 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  57.68 
 
 
488 aa  551  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  57.89 
 
 
465 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2141  phosphomannomutase  57.55 
 
 
463 aa  547  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  57.89 
 
 
461 aa  544  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  57.74 
 
 
881 aa  542  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  57.14 
 
 
465 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  55.7 
 
 
463 aa  537  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  55.65 
 
 
468 aa  535  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  56.8 
 
 
465 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3725  Phosphomannomutase  57.68 
 
 
460 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  57.11 
 
 
462 aa  526  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  56.46 
 
 
462 aa  527  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2822  phosphomannomutase  57.3 
 
 
486 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  57.11 
 
 
462 aa  524  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2443  phosphomannomutase  54.88 
 
 
472 aa  515  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.299376 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2999  phosphomannomutase  55.11 
 
 
475 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  54.37 
 
 
782 aa  511  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  53.95 
 
 
471 aa  509  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  53.95 
 
 
471 aa  511  1e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  54.47 
 
 
469 aa  501  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  53.8 
 
 
467 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  53.73 
 
 
782 aa  491  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2559  phosphomannomutase  53.71 
 
 
460 aa  490  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.344329  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  51.63 
 
 
461 aa  488  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  50.98 
 
 
464 aa  471  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3676  phosphomannomutase  47.88 
 
 
830 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.991755  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  47.05 
 
 
462 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  47.26 
 
 
462 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  45.02 
 
 
456 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  45.25 
 
 
456 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  45.48 
 
 
456 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0113  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  46.49 
 
 
847 aa  396  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  41.46 
 
 
447 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0128  phosphomannomutase  46.07 
 
 
495 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1398  phosphomannomutase  45.03 
 
 
458 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  44.59 
 
 
456 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  41.36 
 
 
450 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  43.18 
 
 
457 aa  375  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0332  phosphomannomutase  42.42 
 
 
469 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  41.72 
 
 
462 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  41.86 
 
 
449 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0485  Phosphomannomutase  42.99 
 
 
466 aa  365  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  40.13 
 
 
455 aa  362  6e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  42.12 
 
 
464 aa  362  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  43.08 
 
 
472 aa  359  6e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  42.73 
 
 
453 aa  358  8e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1915  phosphomannomutase  42.45 
 
 
453 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  40.52 
 
 
469 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  40.34 
 
 
475 aa  353  5e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  38.92 
 
 
474 aa  346  6e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0122  Phosphomannomutase  41.72 
 
 
469 aa  338  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5049  Phosphomannomutase  40.25 
 
 
479 aa  331  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.477893 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3001  phosphomannomutase  42.07 
 
 
460 aa  330  3e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.324631  normal  0.16456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3316  phosphomannomutase  41.99 
 
 
467 aa  323  3e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  41.14 
 
 
460 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  40.04 
 
 
459 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0045  phosphomannomutase  39.96 
 
 
467 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109324  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0306  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  38.51 
 
 
455 aa  319  9e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0317157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  38.58 
 
 
469 aa  317  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0666  integral membrane protein  37.06 
 
 
455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0277597  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0102  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  37.36 
 
 
455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2720  phosphomannomutase  38.99 
 
 
468 aa  302  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>