161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4715 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4727  protein of unknown function DUF1205  84.25 
 
 
416 aa  696    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4715  protein of unknown function DUF1205  100 
 
 
419 aa  836    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4700  protein of unknown function DUF1205  77.11 
 
 
424 aa  589  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.337723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4699  protein of unknown function DUF1205  69.81 
 
 
417 aa  519  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.363631  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4711  protein of unknown function DUF1205  62.26 
 
 
429 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.890895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4716  protein of unknown function DUF1205  59.62 
 
 
424 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4707  protein of unknown function DUF1205  51.31 
 
 
428 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3487  protein of unknown function DUF1205  37.38 
 
 
417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4726  protein of unknown function DUF1205  40.49 
 
 
418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4361  protein of unknown function DUF1205  38.37 
 
 
411 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000257109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4185  IroB  36.08 
 
 
382 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0479104  normal  0.936172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2112  hypothetical protein  30.66 
 
 
467 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0819565  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2933  hypothetical protein  30.8 
 
 
472 aa  160  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697027  normal  0.639426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4360  glycosyl transferase family 28  30.43 
 
 
443 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000448703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2033  hypothetical protein  30.75 
 
 
378 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0492847  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2790  protein of unknown function DUF1205  29.5 
 
 
380 aa  117  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0162419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1263  hypothetical protein  26.53 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2776  protein of unknown function DUF1205  29.44 
 
 
380 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00637482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2047  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.555181  hitchhiker  0.0026549 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1369  glycosyl transferase  26.77 
 
 
374 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2213  hypothetical protein  28.21 
 
 
380 aa  97.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3071  hypothetical protein  25.12 
 
 
371 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2968  hypothetical protein  25.12 
 
 
371 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000610556 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2949  glycosyltransferase  25.12 
 
 
371 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.63295e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2915  IroB  25.12 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2418  glycosyl transferase family protein  22.02 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2885  IroB  25.12 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3553  glycosyltransferase, MGT family  27.82 
 
 
390 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000992125  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5567  hypothetical protein  31.64 
 
 
387 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661467  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1886  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3816  glycosyltransferase, MGT family  29.07 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000289865  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2220  hypothetical protein  31.82 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4978  glycosyltransferase, MGT family  28.25 
 
 
389 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0820  glycosyltransferase, MGT family  27.12 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.894116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2711  glycosyltransferase, MGT family  28.57 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271214  normal  0.0182222 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5063  UDP-glycosyltransferase, MGT  26.29 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5544  glycosyl transferase family 28  25 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888029 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11390  glycosyltransferase, MGT family  25.56 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1778  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.72129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4823  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  25.94 
 
 
436 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1700  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5611  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
396 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126524  hitchhiker  0.000566285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4109  putative glycosyltransferase  31.38 
 
 
456 aa  63.5  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12972  glycosyl transferase  34.43 
 
 
428 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2328  glycosyl transferase family protein  23.99 
 
 
433 aa  63.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0735299  hitchhiker  0.00124939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2021  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
402 aa  63.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3722  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
393 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671186  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0972  glycosyltransferase, MGT family  25.33 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6314  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
402 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1765  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
402 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1867  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
419 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2090  glycosyl transferase family 28  38.83 
 
 
424 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685331  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3135  glycosyltransferase, MGT family  35.29 
 
 
428 aa  59.7  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3906  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  25.79 
 
 
449 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32980  glycosyltransferase, MGT family  35.92 
 
 
381 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12976  glycosyl transferase  33.98 
 
 
449 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4886  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  33.33 
 
 
411 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1445  glycosyltransferase, MGT family  26.67 
 
 
399 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3181  glycosyltransferase, MGT family  23.21 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2497  glycosyltransferase, MGT family  30.25 
 
 
380 aa  57  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4034  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
436 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.468428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4035  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
432 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996814  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2600  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1446  glycosyltransferase, MGT family  24.75 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2409  glycosyl transferase family 28  36.67 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4507  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 
427 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116165  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2132  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.257831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2098  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  32.75 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.228633  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3283  glycosyltransferase, MGT family  31.55 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1566  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
400 aa  55.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.789406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2825  glycosyltransferase, putative  25.5 
 
 
397 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00274597  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0371  UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyltransferase family protein  27.89 
 
 
403 aa  54.3  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.105227  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5032  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
427 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2804  macrolide glycosyltransferase  25 
 
 
397 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3248  glycosyltransferase, MGT family  32.28 
 
 
399 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1076  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.45 
 
 
475 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000121817  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1880  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.45 
 
 
475 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000550735  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0930  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
396 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72237  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2846  macrolide glycosyltransferase  24.18 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0273308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2168  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
400 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6241  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  29.02 
 
 
443 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2801  macrolide glycosyltransferase  24.18 
 
 
397 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756004 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2036  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
397 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746123 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1105  glycosyltransferase, MGT family  29.01 
 
 
429 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0460  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.09 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.276581  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0921  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.09 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0373  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.09 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00103797  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2095  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.09 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000117382  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4929  glycosyltransferase, MGT family  29.14 
 
 
426 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71822  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0461  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.09 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0722  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.09 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000236026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0185  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.09 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1019  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.09 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0812  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.09 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000142515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1919  rhamnosyl transferase  39.09 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000883643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0725  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.09 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1832  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.09 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1421  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.09 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1993  rhamnosyltransferase I, subunit B  39.09 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0101788  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22760  glycosyltransferase, MGT family  29.03 
 
 
389 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>