92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5354 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5354  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
204 aa  390  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.11 
 
 
223 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.05 
 
 
222 aa  141  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2227  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.59 
 
 
229 aa  141  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.09 
 
 
220 aa  135  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  43.89 
 
 
221 aa  134  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1492  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.95 
 
 
216 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.619524  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.7 
 
 
269 aa  91.7  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.24 
 
 
202 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.62 
 
 
154 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.47 
 
 
154 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.19 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  33.79 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.21 
 
 
152 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  6.88113e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.43 
 
 
249 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.71 
 
 
983 aa  86.7  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.16 
 
 
158 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.43 
 
 
241 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.58 
 
 
157 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 
182 aa  84.7  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  38.57 
 
 
987 aa  84.3  1e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30 
 
 
148 aa  84  1e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.5 
 
 
151 aa  84  1e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.46 
 
 
224 aa  83.6  2e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.42 
 
 
224 aa  83.6  2e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  31.25 
 
 
161 aa  82.4  4e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.71 
 
 
1011 aa  82.4  4e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.71 
 
 
1011 aa  82.4  4e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  34.38 
 
 
1012 aa  80.9  1e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.71 
 
 
1012 aa  81.3  1e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  31.16 
 
 
232 aa  80.9  1e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.74 
 
 
204 aa  80.1  2e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 
243 aa  80.5  2e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  31.39 
 
 
148 aa  80.1  2e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 
991 aa  79.7  3e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.43 
 
 
198 aa  79  5e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.05 
 
 
151 aa  78.6  6e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.88 
 
 
216 aa  78.2  7e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.8 
 
 
156 aa  78.6  7e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.03 
 
 
151 aa  77.4  1e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.43 
 
 
213 aa  77.4  1e-13  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  34.29 
 
 
980 aa  77  2e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  36.57 
 
 
176 aa  77  2e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.82 
 
 
176 aa  76.3  3e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.45 
 
 
154 aa  76.3  3e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.95 
 
 
246 aa  76.6  3e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  31.61 
 
 
176 aa  76.3  3e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  32.87 
 
 
997 aa  75.9  4e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 
147 aa  75.5  5e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.76 
 
 
178 aa  75.5  5e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 
155 aa  75.1  6e-13  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.37 
 
 
153 aa  75.1  7e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.86 
 
 
158 aa  74.7  8e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.86 
 
 
158 aa  74.7  8e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.39 
 
 
155 aa  73.9  1e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.83 
 
 
187 aa  74.3  1e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  30 
 
 
150 aa  74.3  1e-12  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  30 
 
 
150 aa  74.3  1e-12  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.25 
 
 
152 aa  73.9  2e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.26 
 
 
193 aa  72  6e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30 
 
 
148 aa  71.2  9e-12  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.17 
 
 
150 aa  70.9  1e-11  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  34.09 
 
 
1019 aa  70.1  2e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1301  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.19 
 
 
988 aa  69.3  3e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.648743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  30.71 
 
 
988 aa  67  2e-10  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.28 
 
 
152 aa  66.6  2e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.08 
 
 
181 aa  65.9  4e-10  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.08 
 
 
151 aa  64.3  1e-09  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.66 
 
 
139 aa  63.5  2e-09  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.548712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.39 
 
 
208 aa  61.2  9e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.01 
 
 
141 aa  60.8  1e-08  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.46 
 
 
149 aa  60.8  1e-08  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.78 
 
 
153 aa  59.3  4e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.08 
 
 
225 aa  54.3  1e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.61 
 
 
185 aa  53.9  2e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.86 
 
 
154 aa  50.1  2e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.51 
 
 
234 aa  49.7  3e-05  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0569  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.8 
 
 
148 aa  49.3  4e-05  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0217411 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.46 
 
 
241 aa  48.9  5e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  25.85 
 
 
200 aa  48.9  5e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.81 
 
 
254 aa  48.5  7e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  28.66 
 
 
253 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.32 
 
 
253 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  25.26 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  25.53 
 
 
206 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.92 
 
 
237 aa  45.1  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.45 
 
 
147 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.88 
 
 
248 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.13 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.78 
 
 
222 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.78 
 
 
222 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.78 
 
 
222 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>