More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3064 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4272  ATP-dependent protease La  80.49 
 
 
775 aa  1200    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  48.23 
 
 
823 aa  667    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  47.7 
 
 
812 aa  664    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2802  ATP-dependent protease La  86.65 
 
 
783 aa  1301    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289517  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5508  ATP-dependent protease La  60.88 
 
 
835 aa  913    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2928  ATP-dependent protease La  54.08 
 
 
760 aa  771    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0257746  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3246  Endopeptidase La  64.01 
 
 
789 aa  947    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171847  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  59.79 
 
 
854 aa  924    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1818  ATP-dependent protease La  65.16 
 
 
798 aa  985    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000643095  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0599  ATP-dependent protease La  71.12 
 
 
804 aa  1082    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737999  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2775  ATP-dependent protease La  86.65 
 
 
783 aa  1301    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.560852  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3336  ATP-dependent protease La  91.31 
 
 
780 aa  1377    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594281  normal  0.0410698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2249  ATP-dependent protease La  67.27 
 
 
778 aa  1006    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.622317  normal  0.359605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  47.92 
 
 
821 aa  667    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  0.00000000135432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5873  ATP-dependent protease La  64.92 
 
 
785 aa  923    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3988  ATP-dependent protease La  72.41 
 
 
769 aa  1112    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.180349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2819  ATP-dependent protease La  86.65 
 
 
783 aa  1301    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246765  normal  0.027393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3064  ATP-dependent protease La  100 
 
 
776 aa  1525    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  44.53 
 
 
793 aa  630  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  45.91 
 
 
840 aa  631  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  43.85 
 
 
817 aa  623  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  45.79 
 
 
809 aa  620  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  43.96 
 
 
823 aa  622  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  45.34 
 
 
776 aa  616  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  45.47 
 
 
776 aa  615  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  44.42 
 
 
793 aa  617  1e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  45.5 
 
 
806 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.82 
 
 
786 aa  616  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  44.49 
 
 
837 aa  615  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  45.34 
 
 
773 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  45.21 
 
 
776 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  42.2 
 
 
810 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  45.21 
 
 
773 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  44.71 
 
 
806 aa  614  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.92 
 
 
784 aa  613  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  44.3 
 
 
816 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  45.47 
 
 
776 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  45.42 
 
 
805 aa  614  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  45.34 
 
 
776 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  44.74 
 
 
898 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.31 
 
 
787 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  43.12 
 
 
846 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.92 
 
 
784 aa  611  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  43.92 
 
 
784 aa  611  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.79 
 
 
784 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.92 
 
 
784 aa  611  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  44.96 
 
 
776 aa  611  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.92 
 
 
784 aa  611  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  45.52 
 
 
778 aa  610  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.92 
 
 
784 aa  611  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.79 
 
 
784 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  43.92 
 
 
784 aa  611  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.79 
 
 
784 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  45.08 
 
 
776 aa  610  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  44.73 
 
 
797 aa  612  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.79 
 
 
784 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.79 
 
 
784 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  43.65 
 
 
817 aa  610  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.92 
 
 
784 aa  611  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.79 
 
 
799 aa  609  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  45.16 
 
 
797 aa  612  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  44.08 
 
 
819 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  44.59 
 
 
785 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  44.7 
 
 
773 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  43.96 
 
 
785 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  44.23 
 
 
805 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.11 
 
 
793 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.53 
 
 
784 aa  608  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  44.1 
 
 
805 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  44.53 
 
 
774 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  44.31 
 
 
813 aa  606  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  44.22 
 
 
804 aa  606  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  42.77 
 
 
794 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  45.84 
 
 
803 aa  607  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  44.1 
 
 
804 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  42.67 
 
 
817 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  43.32 
 
 
816 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  43.83 
 
 
825 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  43.48 
 
 
823 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  44.32 
 
 
784 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  44.1 
 
 
785 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  44.1 
 
 
804 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  44.39 
 
 
785 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.47 
 
 
784 aa  603  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  43.54 
 
 
880 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.11 
 
 
793 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  43.69 
 
 
786 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  42.64 
 
 
794 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  44.39 
 
 
785 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  44.02 
 
 
809 aa  599  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  43.09 
 
 
824 aa  599  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  44.1 
 
 
785 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  44.39 
 
 
828 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  44.53 
 
 
806 aa  599  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  44.62 
 
 
797 aa  600  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  44.1 
 
 
783 aa  602  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  44.25 
 
 
812 aa  598  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  44.16 
 
 
785 aa  600  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  43.38 
 
 
812 aa  599  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  42.39 
 
 
786 aa  600  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>