178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0926 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0926  protein of unknown function DUF55  100 
 
 		 139 aa  288  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3218  hypothetical protein  75.54 
 
 		 144 aa  230  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0742  protein of unknown function DUF55  73.19 
 
 		 140 aa  221  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0729  hypothetical protein  73.19 
 
 		 140 aa  220  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.580961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1136  protein of unknown function DUF55  72.26 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2173  hypothetical protein  72.99 
 
 		 137 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1748  hypothetical protein  70.29 
 
 		 138 aa  215  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0702  protein of unknown function DUF55  72.79 
 
 		 139 aa  214  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1108  hypothetical protein  69.34 
 
 		 163 aa  203  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0254  protein of unknown function DUF55  65.69 
 
 		 137 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049773  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0559  hypothetical protein  64.23 
 
 		 137 aa  193  7e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0472  hypothetical protein  65.69 
 
 		 137 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.904612  normal  0.134048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0291  hypothetical protein  64.23 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0044  hypothetical protein  64.23 
 
 		 137 aa  189  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0317  hypothetical protein  64.23 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0468  hypothetical protein  63.5 
 
 		 137 aa  187  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0164  hypothetical protein  59.12 
 
 		 141 aa  169  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1512  hypothetical protein  59.12 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1341  hypothetical protein  55.4 
 
 		 141 aa  166  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2937  protein of unknown function DUF55  59.42 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.362763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3206  hypothetical protein  55.4 
 
 		 141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162762  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2917  hypothetical protein  56.93 
 
 		 137 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673011  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3573  hypothetical protein  56.2 
 
 		 135 aa  160  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612442  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2001  hypothetical protein  55.88 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2850  hypothetical protein  56.2 
 
 		 137 aa  157  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1891  hypothetical protein  52.55 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1819  hypothetical protein  52.55 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0710947  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2962  hypothetical protein  53.62 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.481941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0060  hypothetical protein  53.28 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3412  protein of unknown function DUF55  51.82 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4016  protein of unknown function DUF55  54.68 
 
 		 143 aa  150  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4077  hypothetical protein  51.09 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0971  hypothetical protein  51.09 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3695  protein of unknown function DUF55  53.96 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2832  hypothetical protein  48.89 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4141  hypothetical protein  50.72 
 
 		 143 aa  144  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0082  hypothetical protein  50.74 
 
 		 135 aa  134  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1041  hypothetical protein  53.85 
 
 		 141 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1261  protein of unknown function DUF55  47.69 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5451  protein of unknown function DUF55  45.19 
 
 		 137 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.794452 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1217  protein of unknown function DUF55  49.62 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.02485  hitchhiker  0.000132613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0061  hypothetical protein  45.89 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177861  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0076  protein of unknown function DUF55  45.21 
 
 		 146 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2368  hypothetical protein  44.44 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.864843  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0059  hypothetical protein  45.21 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1317  hypothetical protein  46.56 
 
 		 148 aa  119  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559236  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0064  protein of unknown function DUF55  44.52 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0724  hypothetical protein  47.76 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.142066  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0926  hypothetical protein  44.44 
 
 		 135 aa  117  6e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2489  hypothetical protein  44.03 
 
 		 142 aa  115  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016498  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0242  protein of unknown function DUF55  43.07 
 
 		 138 aa  114  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0087907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1331  hypothetical protein  47.01 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00023234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0705  hypothetical protein  41.48 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1154  hypothetical protein  42.96 
 
 		 135 aa  110  5e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.306462  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2115  hypothetical protein  40.6 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  41.83 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  40.79 
 
 		 163 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  40.27 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2222  protein of unknown function DUF55  35.71 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.155182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  38.93 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  45.39 
 
 		 158 aa  98.6  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1573  hypothetical protein  39.61 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000165437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  39.04 
 
 		 173 aa  95.9  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3212  hypothetical protein  40.13 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3129  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  40.97 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  39.73 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1312  hypothetical protein  37.25 
 
 		 165 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.29751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  36.49 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000263938  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  39.74 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2287  hypothetical protein  38.26 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2359  hypothetical protein  38.26 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000352986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1486  hypothetical protein  37.4 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0697  protein of unknown function DUF55  38.71 
 
 		 155 aa  90.1  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2477  hypothetical protein  37.58 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0301106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2983  protein of unknown function DUF55  35.42 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.394198 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0836  hypothetical protein  38.41 
 
 		 194 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2609  hypothetical protein  36.24 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3142  hypothetical protein  36.73 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1180  hypothetical protein  34.84 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2770  protein of unknown function DUF55  40.4 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0051852  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2318  protein of unknown function DUF55  36.91 
 
 		 158 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0353  hypothetical protein  37.09 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1969  hypothetical protein  36.91 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0815  hypothetical protein  34.25 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2738  protein of unknown function DUF55  34.42 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10704  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1737  protein of unknown function DUF55  35.57 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2723  hypothetical protein  35.57 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1677  hypothetical protein  35.57 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2648  hypothetical protein  35.57 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2463  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.563467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1847  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2458  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0319  hypothetical protein  38.26 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2217  hypothetical protein  35.1 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2196  hypothetical protein  29.61 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1853  protein of unknown function DUF55  29.61 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.890211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5205  hypothetical protein  37.58 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5031  hypothetical protein  36.91 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2507  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>