25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1575 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  100 
 
 		 322 aa  652    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0782  GHMP kinase  53.58 
 
 		 323 aa  344  1e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  28.74 
 
 		 375 aa  91.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0630  phosphomevalonate kinase  28.05 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0615  phosphomevalonate kinase  28.05 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0240  phosphomevalonate kinase  27.47 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52257  Phosphomevalonate kinase  27.49 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.435528  normal  0.126938 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  28.39 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  24.73 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  27.68 
 
 		 779 aa  57  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1102  phosphomevalonate kinase  26.91 
 
 		 249 aa  55.8  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.029164  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02311  phosphomevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_5G10680)  40.54 
 
 		 480 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000089901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  25.54 
 
 		 290 aa  53.5  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  25.08 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0707  putative phosphomevalonate kinase  26.51 
 
 		 317 aa  50.1  0.00006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  23.12 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  23.58 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  26.21 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  27.11 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0600  phosphomevalonate kinase  21.86 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  24.07 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00100  expressed protein  27.74 
 
 		 560 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1387  phosphomevalonate kinase  26.32 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  22.88 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  25.91 
 
 		 314 aa  42.7  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>