282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1250 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1250  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
95 aa  201  3e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  71.58 
 
 
95 aa  154  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.96 
 
 
92 aa  101  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1259  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.96 
 
 
92 aa  99.8  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0061  ferredoxin  46.39 
 
 
92 aa  94  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664863 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0959  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.3 
 
 
110 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.27 
 
 
111 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.362888  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.24 
 
 
92 aa  90.5  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200948  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.16 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.512756  hitchhiker  0.00122416 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1541  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.05 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.74 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2370  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.09 
 
 
96 aa  84.3  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2134  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.09 
 
 
96 aa  84  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1938  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.09 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.62 
 
 
98 aa  82  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000449419  decreased coverage  0.000160818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1477  ferredoxin-like protein  41.84 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1193  putative ferredoxin like protein; FixX  41.84 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.170567 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2197  iron-sulfur cluster-binding protein FixX  40.62 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1433  putative ferredoxin like protein; FixX  42.42 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102242  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1371  putative ferredoxin like protein; FixX  43.88 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2316  putative ferredoxin like protein; FixX  41.84 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00117269  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10550  FixX ferredoxin-like protein  38.14 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0834352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.84 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3926  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.73 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.540804 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4275  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.63 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4603  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  34.38 
 
 
93 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.35 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7736  putative ferredoxin like protein; FixX  35.71 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.73 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0490  putative ferredoxin protein, FixX  36.27 
 
 
100 aa  60.8  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3574  ferredoxin-like protein  37.62 
 
 
94 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.183526  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3065  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.63 
 
 
571 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3555  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.25 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2264  ferredoxin  37.11 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0290114  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0574  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.88 
 
 
548 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2123  hypothetical protein  31.25 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0623  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.88 
 
 
548 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03178  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  36.05 
 
 
549 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420637  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4617  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.72 
 
 
557 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288677  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4247  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.72 
 
 
557 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.05315  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0139  putative ferredoxin protein, FixX  34.31 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4767  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.72 
 
 
557 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0589  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.02 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000249296  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4926  FixX ferredoxin-like protein  34.34 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4075  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.88 
 
 
557 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.556531  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4012  ferredoxin-like protein  36.63 
 
 
94 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1435  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.31 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3861  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  27.45 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00147528  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3613  putative ferredoxin protein, FixX  36.08 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122758 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1891  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.21 
 
 
556 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4358  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  36.36 
 
 
552 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0903296  normal  0.0136742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5869  putative ferredoxin protein, FixX  33.33 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0942  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.33 
 
 
554 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589953  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0484  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.94 
 
 
548 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6231  FixX ferredoxin-like protein  32.99 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1211  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.48 
 
 
552 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5083  putative ferredoxin protein, FixX  34.31 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6299  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.23 
 
 
549 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0649  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.23 
 
 
554 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1091  ferredoxin like protein, fixX  33.67 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2374  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.46 
 
 
557 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1084  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.33 
 
 
552 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.29604  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4445  ferredoxin like protein, fixX  32.65 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1392  electrotransfer ubiquinone oxidoreductase  34.09 
 
 
553 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1091  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.33 
 
 
554 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.358633 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1552  ferredoxin-like protein  32.67 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281745  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1229  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.33 
 
 
552 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0987  ferredoxin like protein, fixX  33.67 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0910173 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0319  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.06 
 
 
559 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.013654 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2714  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.14 
 
 
558 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  normal  0.490703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2346  putative electron transfer flavoprotein dehydrogenase  34.09 
 
 
552 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  0.0520477 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_42245  predicted protein  36.36 
 
 
575 aa  50.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3687  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.67 
 
 
542 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0620  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  31.25 
 
 
563 aa  50.1  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0621  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  31.25 
 
 
563 aa  50.1  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.994915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0228  FAD dependent oxidoreductase:electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  30.34 
 
 
547 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2658  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.25 
 
 
568 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09260  ferredoxin-like protein  35.35 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.759582 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27810  ferredoxin-like protein  33.33 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1567  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.52 
 
 
557 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0158  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.95 
 
 
558 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00048  predicted 4Fe-4S ferredoxin-type protein  31.63 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3555  putative ferredoxin  31.63 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00047  hypothetical protein  31.63 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0050  ferredoxin homolog FixX  31.63 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0046  ferredoxin homolog FixX  31.63 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.922786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0048  ferredoxin homolog FixX  31.63 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3611  putative ferredoxin  31.63 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1028  putative ferredoxin  28.87 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1821  putative ferredoxin  33.67 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.09414  normal  0.305366 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0048  ferredoxin homolog FixX  31.63 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2188  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  30.95 
 
 
557 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1844  putative ferredoxin  32.65 
 
 
98 aa  48.9  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.148081  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3107  putative ferredoxin  33.67 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394196 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1185  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.87 
 
 
551 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.068389  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2059  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.09 
 
 
558 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1346  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.14 
 
 
557 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04420  oxidoreductase, putative  37.5 
 
 
615 aa  47.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2595  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 
553 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.399286 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1371  hydrogenase large subunit domain protein  30.65 
 
 
508 aa  47.8  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000870686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>