88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3861 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3861  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
96 aa  199  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00147528  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.11 
 
 
98 aa  82.4  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000449419  decreased coverage  0.000160818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3926  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.14 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.540804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0959  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.76 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1435  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.86 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.11 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200948  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0589  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.46 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000249296  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.73 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.362888  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3555  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.18 
 
 
92 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0061  ferredoxin  32.99 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664863 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2134  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4603  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  34.02 
 
 
93 aa  60.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2370  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.96 
 
 
96 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4275  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.26 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.14 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1938  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.69 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.9 
 
 
96 aa  57.8  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.512756  hitchhiker  0.00122416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.47 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.63 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7736  putative ferredoxin like protein; FixX  34.15 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1250  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.45 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.61 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2197  iron-sulfur cluster-binding protein FixX  36 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1541  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.21 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10550  FixX ferredoxin-like protein  36.14 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0834352  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2316  putative ferredoxin like protein; FixX  34.34 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00117269  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1371  putative ferredoxin like protein; FixX  31.31 
 
 
98 aa  53.9  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1433  putative ferredoxin like protein; FixX  31.31 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102242  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.29 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1259  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.29 
 
 
92 aa  52  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6231  FixX ferredoxin-like protein  31.25 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4926  FixX ferredoxin-like protein  31.25 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5869  putative ferredoxin protein, FixX  32.99 
 
 
98 aa  50.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1552  ferredoxin-like protein  36.25 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281745  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4445  ferredoxin like protein, fixX  31.96 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1193  putative ferredoxin like protein; FixX  30.3 
 
 
95 aa  48.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.170567 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1477  ferredoxin-like protein  30.3 
 
 
95 aa  48.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0139  putative ferredoxin protein, FixX  30.93 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0490  putative ferredoxin protein, FixX  30.93 
 
 
100 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2264  ferredoxin  32.05 
 
 
96 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0290114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0921  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.801629  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1398  ferredoxin-like protein  31.63 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0672004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5083  putative ferredoxin protein, FixX  31.96 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2896  putative ferredoxin  32.29 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0987  ferredoxin like protein, fixX  30.93 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0910173 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2123  hypothetical protein  28.12 
 
 
94 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0314  putative ferredoxin  30.93 
 
 
98 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.71 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02612  predicted 4Fe-4S cluster-containing protein  31.25 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1091  ferredoxin like protein, fixX  30.93 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02575  hypothetical protein  31.25 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0945  hypothetical protein  31.25 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1454  formate dehydrogenase iron-sulfur subunit  27.47 
 
 
202 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.76 
 
 
189 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3613  putative ferredoxin protein, FixX  30.49 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.76 
 
 
189 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2857  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  44.23 
 
 
363 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0575  hypothetical protein  28.87 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02279  hypothetical protein  27.47 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2907  putative ferredoxin  31.25 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 
189 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3069  putative ferredoxin  31.25 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3921  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 
189 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003493  formate dehydrogenase-O iron-sulfur subunit  28.77 
 
 
202 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.781415  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4136  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 
195 aa  41.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3725  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 
189 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.945893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.78 
 
 
505 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4225  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 
198 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4107  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 
198 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4061  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.76 
 
 
207 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 
198 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4514  formate dehydrogenase, iron-sulfur subunit  35.29 
 
 
189 aa  41.2  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1844  putative ferredoxin  27.84 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.148081  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4141  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.82 
 
 
187 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4111  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.82 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0332  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.82 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3106  putative ferredoxin  31.25 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0911919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0228  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.82 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.208546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3608  formate dehydrogenase, iron-sulfur subunit  30.56 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.934801  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1119  formate dehydrogenase, iron-sulfur subunit  28.77 
 
 
202 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4229  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.82 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 
544 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4012  ferredoxin-like protein  36.67 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  36.73 
 
 
644 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4808  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.76 
 
 
189 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.130665 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09260  ferredoxin-like protein  31.96 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.759582 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0826  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.96 
 
 
290 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.456619  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3574  ferredoxin-like protein  36.67 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.183526  normal  0.204612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>