More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2773 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
92 aa  193  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0061  ferredoxin  58.7 
 
 
92 aa  121  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1541  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  57.3 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1938  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  56.04 
 
 
106 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.19 
 
 
92 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1259  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.19 
 
 
92 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.24 
 
 
95 aa  93.6  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1250  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.24 
 
 
95 aa  90.5  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0959  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.94 
 
 
110 aa  90.9  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.09 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.362888  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0589  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.83 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000249296  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2134  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
96 aa  84.3  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2370  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.39 
 
 
96 aa  84  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.13 
 
 
98 aa  83.6  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000449419  decreased coverage  0.000160818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1477  ferredoxin-like protein  45.26 
 
 
95 aa  83.6  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1193  putative ferredoxin like protein; FixX  45.26 
 
 
95 aa  83.6  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.170567 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.66 
 
 
97 aa  82  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2197  iron-sulfur cluster-binding protein FixX  40.22 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3926  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.26 
 
 
95 aa  80.1  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.540804 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4603  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  41.94 
 
 
93 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1433  putative ferredoxin like protein; FixX  43.16 
 
 
99 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102242  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.95 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.22 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.512756  hitchhiker  0.00122416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3555  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.39 
 
 
92 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10550  FixX ferredoxin-like protein  41.94 
 
 
94 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0834352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.53 
 
 
94 aa  77  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2316  putative ferredoxin like protein; FixX  41.05 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00117269  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4275  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.39 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7736  putative ferredoxin like protein; FixX  41.05 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1371  putative ferredoxin like protein; FixX  40 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.39 
 
 
87 aa  69.7  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1552  ferredoxin-like protein  40.86 
 
 
94 aa  67  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281745  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0987  ferredoxin like protein, fixX  40.4 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0910173 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2123  hypothetical protein  40.22 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0490  putative ferredoxin protein, FixX  38.3 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6231  FixX ferredoxin-like protein  36.96 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3861  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  37.11 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00147528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4445  ferredoxin like protein, fixX  40.62 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2264  ferredoxin  37.63 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0290114  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4926  FixX ferredoxin-like protein  41.94 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5083  putative ferredoxin protein, FixX  40.62 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3574  ferredoxin-like protein  40.86 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.183526  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0139  putative ferredoxin protein, FixX  36.17 
 
 
99 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4012  ferredoxin-like protein  41.49 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1091  ferredoxin like protein, fixX  40.21 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5869  putative ferredoxin protein, FixX  36.17 
 
 
98 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3613  putative ferredoxin protein, FixX  39.78 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122758 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1435  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.67 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1844  putative ferredoxin  33.33 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.148081  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0623  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.67 
 
 
548 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0574  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.67 
 
 
548 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0314  putative ferredoxin  38.3 
 
 
98 aa  57.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1398  ferredoxin-like protein  36.46 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0672004  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0575  hypothetical protein  35.11 
 
 
94 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00048  predicted 4Fe-4S ferredoxin-type protein  35.48 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3555  putative ferredoxin  35.48 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3611  putative ferredoxin  35.48 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09260  ferredoxin-like protein  37.76 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.759582 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00047  hypothetical protein  35.48 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0050  ferredoxin homolog FixX  35.48 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0046  ferredoxin homolog FixX  35.48 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.922786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0048  ferredoxin homolog FixX  35.48 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2188  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.29 
 
 
557 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0048  ferredoxin homolog FixX  35.48 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1084  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.51 
 
 
552 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.29604  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1229  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.51 
 
 
552 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1028  putative ferredoxin  34.04 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2346  putative electron transfer flavoprotein dehydrogenase  31.13 
 
 
552 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  0.0520477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1211  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.93 
 
 
552 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3107  putative ferredoxin  46.43 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394196 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0921  conserved hypothetical protein  42.59 
 
 
86 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.801629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2907  putative ferredoxin  44.44 
 
 
86 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1821  putative ferredoxin  46.43 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.09414  normal  0.305366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2374  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  40 
 
 
557 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694979 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3069  putative ferredoxin  44.44 
 
 
86 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  35.11 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.38578 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0087  ferredoxin-like protein ydiT  35.11 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0085  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  35.11 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.807465  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0084  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  35.11 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.588767  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3218  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  41.51 
 
 
580 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0084  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  35.11 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.951067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03178  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  29.7 
 
 
549 aa  50.8  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420637  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2595  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
553 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.399286 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3106  putative ferredoxin  44.44 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0911919  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4358  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.62 
 
 
552 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0903296  normal  0.0136742 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4065  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.92 
 
 
713 aa  50.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.929518  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27810  ferredoxin-like protein  34.02 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1993  ferredoxin like protein  48.15 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0887759  normal  0.0253227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1463  ferredoxin like protein  48.15 
 
 
97 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0484  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.19 
 
 
548 aa  50.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1821  putative ferredoxin  48.15 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1903  iron-sulfur cluster-binding protein  48.15 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1917  iron-sulfur cluster-binding protein  48.15 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1447  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  48.15 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.128489 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1495  iron-sulfur cluster-binding protein  48.15 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.306818 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4022  putative ferredoxin  42.59 
 
 
86 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.878654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  48.15 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1481  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  48.15 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0731484 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01669  predicted 4Fe-4S ferredoxin-type protein  48.15 
 
 
97 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01658  hypothetical protein  48.15 
 
 
97 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>