96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4445 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4445  ferredoxin like protein, fixX  100 
 
 		 98 aa  206  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1091  ferredoxin like protein, fixX  88.78 
 
 		 98 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0987  ferredoxin like protein, fixX  84.69 
 
 		 98 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0910173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5083  putative ferredoxin protein, FixX  85.71 
 
 		 98 aa  180  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0139  putative ferredoxin protein, FixX  77.32 
 
 		 99 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5869  putative ferredoxin protein, FixX  72.45 
 
 		 98 aa  157  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0490  putative ferredoxin protein, FixX  72.92 
 
 		 100 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6231  FixX ferredoxin-like protein  65.31 
 
 		 98 aa  148  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1552  ferredoxin-like protein  68.13 
 
 		 94 aa  143  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281745  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3574  ferredoxin-like protein  68.13 
 
 		 94 aa  143  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.183526  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4012  ferredoxin-like protein  65.93 
 
 		 94 aa  140  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3613  putative ferredoxin protein, FixX  65.93 
 
 		 97 aa  137  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122758 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4926  FixX ferredoxin-like protein  61.54 
 
 		 98 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2264  ferredoxin  54.95 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0290114  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10550  FixX ferredoxin-like protein  51.09 
 
 		 94 aa  107  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0834352  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1433  putative ferredoxin like protein; FixX  52.94 
 
 		 99 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102242  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2316  putative ferredoxin like protein; FixX  50 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00117269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7736  putative ferredoxin like protein; FixX  47.87 
 
 		 99 aa  97.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1371  putative ferredoxin like protein; FixX  49.48 
 
 		 98 aa  97.1  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1477  ferredoxin-like protein  46.81 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1193  putative ferredoxin like protein; FixX  46.81 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.170567 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.74 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1259  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0575  hypothetical protein  40.22 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2123  hypothetical protein  50.67 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00048  predicted 4Fe-4S ferredoxin-type protein  43.48 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0048  ferredoxin homolog FixX  43.48 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00047  hypothetical protein  43.48 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0046  ferredoxin homolog FixX  43.48 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.922786 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3555  putative ferredoxin  43.48 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3611  putative ferredoxin  43.48 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0050  ferredoxin homolog FixX  43.48 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0048  ferredoxin homolog FixX  42.39 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1447  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  38.38 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.128489 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1993  ferredoxin like protein  36.73 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0887759  normal  0.0253227 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1821  putative ferredoxin  36.73 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0087  ferredoxin-like protein ydiT  41.94 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0085  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.807465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  41.94 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.38578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1481  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0731484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0084  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.588767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1398  ferredoxin-like protein  38.38 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0672004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1463  ferredoxin like protein  36.73 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0084  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  41.94 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.951067 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3926  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.86 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.540804 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4603  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  36.96 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0061  ferredoxin  41 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664863 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.63 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000449419  decreased coverage  0.000160818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0959  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1028  putative ferredoxin  38.04 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01658  hypothetical protein  34.69 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01669  predicted 4Fe-4S ferredoxin-type protein  34.69 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2370  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1903  iron-sulfur cluster-binding protein  34.69 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  34.69 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1495  iron-sulfur cluster-binding protein  34.69 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.306818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1917  iron-sulfur cluster-binding protein  34.69 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1942  iron-sulfur cluster-binding protein  34.69 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.332806  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2134  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.362888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3107  putative ferredoxin  36.84 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394196 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1821  putative ferredoxin  36.84 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.09414  normal  0.305366 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3233  putative ferredoxin  34.78 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1844  putative ferredoxin  35.48 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.148081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1931  hypothetical protein  33.67 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0527008 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4042  putative ferredoxin  34.78 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0314  putative ferredoxin  34.69 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2680  putative ferredoxin  35.79 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27810  ferredoxin-like protein  35.35 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.512756  hitchhiker  0.00122416 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.62 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1541  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.66 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08760  ferredoxin-like protein  33.67 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.696801 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09260  ferredoxin-like protein  36.08 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.759582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1938  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.95 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3106  putative ferredoxin  35.62 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0911919  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2907  putative ferredoxin  35.62 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3069  putative ferredoxin  35.62 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4022  putative ferredoxin  34.25 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878654 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0921  conserved hypothetical protein  32.88 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.801629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02612  predicted 4Fe-4S cluster-containing protein  32.88 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02575  hypothetical protein  32.88 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0945  hypothetical protein  32.88 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2197  iron-sulfur cluster-binding protein FixX  33.64 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3555  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.94 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2896  putative ferredoxin  31.51 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4275  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.56 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1250  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.65 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.67 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3861  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  31.96 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00147528  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1435  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.71 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0484  monooxygenase FAD-binding protein  30.77 
 
 		 561 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35565  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.78 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0589  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.18 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000249296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>