34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5012 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  50.21 
 
 		 342 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  52.86 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  51.6 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  34.36 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  37.39 
 
 		 283 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  32.92 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  32.92 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  31.53 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  32.22 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  31.06 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  30.56 
 
 		 276 aa  95.9  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  31.15 
 
 		 299 aa  95.9  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  27.59 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  27.31 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  34.96 
 
 		 260 aa  92.8  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  32.16 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  30.36 
 
 		 278 aa  85.5  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  26 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  31.62 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  31.2 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  31.2 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  28.02 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  27.31 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  28.43 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  33.89 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  25.21 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  27.41 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  26.9 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  27.61 
 
 		 342 aa  48.9  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0151  electron transport protein SCO1/SenC  20.93 
 
 		 205 aa  43.5  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000503505  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  25.95 
 
 		 208 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  25.95 
 
 		 208 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>