114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5408 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5408  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
119 aa  238  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3250  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  48.08 
 
 
123 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.493991  normal  0.819791 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.45 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.35 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.42 
 
 
116 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.14 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.04 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.04 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.46 
 
 
115 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1937  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.22 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  40.54 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.61 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  36.19 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3061  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.71 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4624  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.45 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1107  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.13 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4869  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.87 
 
 
148 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536474  unclonable  0.0000000999645 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  34.29 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2866  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.13 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134272  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  33.98 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.98 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.35 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  33.98 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  33.98 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  33.98 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  33.98 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  33.98 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  33.98 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2715  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.86 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0883325 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  36.7 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0041  mRNA endonuclease-like protein PemK  36.78 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  33.01 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01482  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.25 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.09 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.14 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.19 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1144  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.21 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1876  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.56 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12814  hypothetical protein  36.84 
 
 
118 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000412903  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0974  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.93 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.836231  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.25 
 
 
116 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2105  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.36 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2143  PemK family protein  30.36 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2605  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.29 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1630  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3503  plasmid stable inheritance protein K  36.27 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.25 
 
 
116 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2436  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.43 
 
 
128 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  30.28 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
109 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4177  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.11 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.150234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1194  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300764 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.41 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.36 
 
 
116 aa  50.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1681  PemK family transcriptional regulator  29.46 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1707  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  33.33 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000119812 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.65 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.36 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0771  toxin ChpB  35.71 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  32.65 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1971  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4478  toxin ChpB  37.25 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4794  toxin ChpB  37.25 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.1 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5742  toxin ChpB  37.25 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1718  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.23 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341117  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.39 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1483  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.36 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.73 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.78 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1191  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.45 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.325689  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5455  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.29 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724766  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  27.35 
 
 
117 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0033  PemK-like protein  30.95 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.36 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  27.35 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4703  toxin ChpB  36.27 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0309  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.46 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1093  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.57 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1879  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.57 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1811  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  33.33 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0166728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2894  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.44 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4418  toxin ChpB  35.71 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0359  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.19 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0212  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.57 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.200733  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1640  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  28.83 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0998854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2437  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.95 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.68 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000815798  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  28.32 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21830  growth inhibitor  35.64 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000000451152  normal  0.350233 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0890  toxin ChpB  31.63 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3386  PemK family protein  34.82 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1831  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.14 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0402  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.88 
 
 
107 aa  43.5  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0232  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.68 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0269  transcriptional regulator, PemK family  27.68 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.76825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5056  transcriptional regulator, PemK family  27.68 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213232  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.09 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>