155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0286 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  100 
 
 
117 aa  236  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  99.15 
 
 
117 aa  234  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  82.88 
 
 
116 aa  192  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  77.48 
 
 
116 aa  186  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0359  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  74.34 
 
 
116 aa  183  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  74.34 
 
 
147 aa  179  8.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  72.97 
 
 
116 aa  179  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1093  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  72.07 
 
 
116 aa  174  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0212  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  72.07 
 
 
116 aa  174  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.200733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0269  transcriptional regulator, PemK family  71.17 
 
 
116 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.76825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5056  transcriptional regulator, PemK family  71.17 
 
 
116 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213232  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0232  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  71.17 
 
 
116 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0309  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  69.03 
 
 
116 aa  172  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0274  PemK family transcriptional regulator  71.17 
 
 
116 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0240  PemK family transcriptional regulator  71.17 
 
 
116 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0226  pemK-like protein  71.17 
 
 
116 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0228  pemK-like protein  71.17 
 
 
116 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0254  PemK family transcriptional regulator  71.17 
 
 
116 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.725358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0266  transcriptional regulator, PemK family  71.17 
 
 
116 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0240  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  71.17 
 
 
116 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  67.57 
 
 
133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000297621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0288  transcriptional regulator, PemK family  71.17 
 
 
116 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2894  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  69.91 
 
 
116 aa  168  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  72.07 
 
 
116 aa  167  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2105  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  68.47 
 
 
120 aa  167  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2143  PemK family protein  68.47 
 
 
120 aa  167  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  69.03 
 
 
116 aa  166  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0974  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  62.83 
 
 
116 aa  163  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.836231  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0256  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  62.07 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000117261  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1681  PemK family transcriptional regulator  68.47 
 
 
120 aa  160  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  66.67 
 
 
116 aa  160  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  65.77 
 
 
116 aa  157  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000815798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1879  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  62.16 
 
 
115 aa  157  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1811  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  57.89 
 
 
121 aa  137  6e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0166728  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1640  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  56.36 
 
 
118 aa  135  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0998854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2436  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  58.56 
 
 
128 aa  134  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1831  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.36 
 
 
118 aa  98.2  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2715  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40 
 
 
119 aa  94.7  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0883325 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.26 
 
 
118 aa  90.1  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1424  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.35 
 
 
88 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905577  normal  0.0149694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1568  PemK-like protein  45.63 
 
 
112 aa  87  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2716  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.47 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1380  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.75 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4547  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.07 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2646  MazE/toxin transcriptional modulator MazF  40.18 
 
 
114 aa  80.1  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.78 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.930315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0962  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  48.81 
 
 
170 aa  76.6  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1630  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.5 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1718  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.84 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341117  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  39.05 
 
 
110 aa  72  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1483  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.74 
 
 
118 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1194  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.74 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300764 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1191  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.74 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.325689  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12023  hypothetical protein  38.05 
 
 
114 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0346  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.71 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.59 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.04 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0572  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.89 
 
 
107 aa  67  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.6 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0821  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.48 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.51 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2564  PemK family protein  43.62 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.58 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12814  hypothetical protein  31.03 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000412903  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1185  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.64 
 
 
106 aa  62  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2003  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.35 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5889  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.57 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000397508 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1876  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.56 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1144  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.9 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1971  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.14 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1327  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.03 
 
 
72 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1319  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.19 
 
 
117 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00212253  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0676  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.04 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3202  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.57 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1105  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.35 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1707  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  31.93 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000119812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2049  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.42 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5455  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.43 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724766  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.57 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  30 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0033  PemK-like protein  30.91 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0630  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.37 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647439  decreased coverage  0.00158876 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2312  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.66 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113933  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4535  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.21 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0469599  normal  0.805558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3386  PemK family protein  28.7 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.91 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4177  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.31 
 
 
107 aa  55.1  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.150234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2435  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.82 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.250291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0832  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.78 
 
 
113 aa  53.9  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.737175  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.02 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.02 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2528  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.58 
 
 
118 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0310  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.43 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0395146  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0793  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.43 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109147  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0762  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.43 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2437  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  32.04 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1011  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.83 
 
 
107 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0041  mRNA endonuclease-like protein PemK  32.98 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>