85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21830 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_21830  growth inhibitor  100 
 
 		 110 aa  219  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000000451152  normal  0.350233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3386  PemK family protein  52 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  33.91 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1971  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.99 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0974  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.08 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.836231  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.3 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.84 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2335  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.29 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4757  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424428  normal  0.0249219 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.3 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1191  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.42 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.325689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1483  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.77 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1144  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.05 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0309  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.69 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  33.67 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.07 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2894  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.52 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.67 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  33.67 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  33.67 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  33.67 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  33.67 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  25.23 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1879  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.16 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  22.94 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1105  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  33.67 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  33.67 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  33.67 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.45 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  33.67 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.66 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2436  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.43 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.23 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.02 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.49 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000815798  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.47 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.84 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.47 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1107  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  48.15 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2646  MazE/toxin transcriptional modulator MazF  33.67 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0295  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.86 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.021419  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0676  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.85 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5408  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.64 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2049  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.87 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  34.34 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0359  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.43 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.21 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.07 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  24.78 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1707  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  31.71 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000119812 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  24.78 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.13 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1380  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.43 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3250  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.65 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.493991  normal  0.819791 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.13 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12814  hypothetical protein  36.63 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000412903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1194  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.98 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300764 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4624  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.35 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.86 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.61 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0256  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.43 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000117261  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1811  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  26.04 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0166728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1093  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.67 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0212  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.67 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.200733  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.63 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5056  transcriptional regulator, PemK family  26.67 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0232  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.67 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0269  transcriptional regulator, PemK family  26.67 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.76825  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4547  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.92 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0274  PemK family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0240  PemK family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0226  pemK-like protein  27.96 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0254  PemK family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.725358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0228  pemK-like protein  27.96 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0240  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.96 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0266  transcriptional regulator, PemK family  27.96 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2605  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.26 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0288  transcriptional regulator, PemK family  27.96 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1831  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.57 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  24.55 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.07 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1071  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.73 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  32.89 
 
 		 110 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>