150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2197 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2197  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  154  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2522  RNA-binding S4 domain-containing protein  61.33 
 
 		 74 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0154969 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1687  hypothetical protein  56.72 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.643727  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2823  hypothetical protein  56.72 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0464209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0503  hypothetical protein  56.72 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000422283  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2938  hypothetical protein  56.72 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196039  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2510  hypothetical protein  56.72 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000911795  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2771  hypothetical protein  56.72 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00316834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2884  hypothetical protein  56.72 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1834  hypothetical protein  56.72 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0149554  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0972  hypothetical protein  55.22 
 
 		 72 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0910033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4205  hypothetical protein  55.22 
 
 		 72 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00355095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0613  hypothetical protein  55.22 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0968  hypothetical protein  55.22 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190489  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1092  hypothetical protein  55.22 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1051  hypothetical protein  55.22 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751549  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0832  hypothetical protein  50.68 
 
 		 80 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.17612  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1042  hypothetical protein  52.24 
 
 		 72 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2211  hypothetical protein  53.73 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0528785  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2942  hypothetical protein  52.24 
 
 		 72 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0798  hypothetical protein  52.24 
 
 		 72 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123896 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0805  hypothetical protein  52.24 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0735  hypothetical protein  52.24 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.673905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04773  hypothetical protein  47.95 
 
 		 80 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1157  hypothetical protein  54.41 
 
 		 74 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0334901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0676  RNA-binding S4  52.94 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2003  RNA-binding S4 domain protein  53.42 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1224  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  70.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0985687 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0789  hypothetical protein  46.58 
 
 		 73 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0110  hypothetical protein  48.53 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6671  hypothetical protein  46.38 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.0976686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2636  putative RNA-binding protein  47.76 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0140325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1729  RNA-binding S4 domain protein  49.18 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180543  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1650  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.19 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.944903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1635  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.19 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0673485  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2708  RNA-binding S4 domain protein  39.19 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.368118  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1672  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.19 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0817  hypothetical protein  53.57 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0041  RNA-binding S4 domain protein  39.39 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2373  RNA-binding S4  40.91 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00030  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0003  S4 domain protein YaaA  45.59 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313437  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1527  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.46 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2155  hypothetical protein  37.31 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.323809  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0053  RNA-binding S4 domain protein  45.31 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.525969  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1990  hypothetical protein  39.39 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1550  S4 domain protein YaaA  37.68 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2642  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.62 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0497559  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2454  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.84 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000184888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2524  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.84 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0627424  unclonable  0.0000273439 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0173  S4 domain protein YaaA  43.33 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2616  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.84 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000166621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.94 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.212549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1515  RNA-binding S4 domain protein  38.81 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.686645 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1647  RNA-binding S4  50.88 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.423975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0464  S4 domain-containing protein  53.7 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0103248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0414  RNA-binding S4 domain protein  55.77 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.34 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0003  RNA-binding S4 domain protein  41.27 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.241542  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0002  RNA-binding S4 domain protein  34.85 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000678168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0618  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2293  RNA-binding S4 domain protein  42.65 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0342  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.85 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000486446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1167  hypothetical protein  47.27 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  normal  0.0222508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0098  RNA-binding S4  47.37 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000456096  normal  0.262898 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1301  RNA-binding S4 domain protein  47.54 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517293  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2457  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.1 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1581  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.44 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0305147  normal  0.476483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3069  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.16 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000897832  hitchhiker  0.000868663 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1502  RNA-binding S4  37.88 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1328  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.25 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1365  RNA-binding S4 domain protein  40.58 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000548467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5767  hypothetical protein  43.94 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3643  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.08 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2468  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.26 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000314319 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.42 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5317  hypothetical protein  41.82 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0232645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0081  RNA-binding S4  51.92 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0003  hypothetical protein  41.82 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000654454  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13901  S4 domain-containing protein  52.63 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.453758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2770  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.28 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.013443  normal  0.790943 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0004  RNA-binding S4  46.55 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000361246  hitchhiker  0.0000000730719 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0003  RNA-binding S4  50.91 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000218407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0003  S4 region YaaA family protein  41.82 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00478  predicted RNA-binding protein  41.79 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3085  conserved hypothetical protein  41.79 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000297466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0003  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0003  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0003  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0629  hypothetical protein  41.79 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0306723  normal  0.860883 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0003  S4 domain protein YaaA  49.06 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2397  RNA-binding S4 domain protein  42.62 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0714362  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0569  hypothetical protein  41.79 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000593229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00483  hypothetical protein  41.79 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.325601  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3094  hypothetical protein  41.79 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0341601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0573  hypothetical protein  41.79 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0326332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0446  hypothetical protein  41.79 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000152535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0003  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0003  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0003  hypothetical protein  42.59 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0881433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>