156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0464 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0464  S4 domain-containing protein  100 
 
 		 71 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0103248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0098  RNA-binding S4  75.38 
 
 		 65 aa  99.4  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000456096  normal  0.262898 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0414  RNA-binding S4 domain protein  72.31 
 
 		 65 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0342  RNA-binding S4 domain-containing protein  73.85 
 
 		 65 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000486446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0173  S4 domain protein YaaA  67.65 
 
 		 72 aa  93.6  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00030  RNA-binding S4 domain protein  61.9 
 
 		 72 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0618  RNA-binding S4 domain-containing protein  60.32 
 
 		 70 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2373  RNA-binding S4  57.58 
 
 		 68 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.41 
 
 		 70 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.212549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0414  RNA-binding S4 domain protein  70.77 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0499509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2293  RNA-binding S4 domain protein  56.14 
 
 		 70 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3643  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.72 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3096  RNA-binding S4  59.32 
 
 		 72 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3156  RNA-binding S4 domain-containing protein  59.32 
 
 		 72 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.914223  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3116  RNA-binding S4 domain-containing protein  57.63 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6817  hypothetical protein  55 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0003  S4 domain protein YaaA  56.45 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313437  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1550  S4 domain protein YaaA  50 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0081  RNA-binding S4  50 
 
 		 69 aa  67  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3479  RNA-binding S4  54.84 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10421  S4 domain-containing protein  66.67 
 
 		 58 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09031  hypothetical protein  64.58 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0003  S4 domain-containing protein  51.56 
 
 		 68 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0003  S4 domain-containing protein  51.56 
 
 		 68 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1607  RNA-binding S4 domain protein  53.97 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.932623 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0383  RNA-binding S4  52.63 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10421  S4 domain-containing protein  64.58 
 
 		 58 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0972  RNA-binding S4  64.58 
 
 		 58 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0002  RNA-binding S4 domain protein  52.31 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000678168  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0126  RNA-binding S4 domain protein  59.65 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0053  RNA-binding S4 domain protein  59.02 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.525969  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10651  S4 domain-containing protein  52.63 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0278753 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0003  RNA-binding S4  64.15 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000218407  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.03 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2770  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.24 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.013443  normal  0.790943 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1437  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.55 
 
 		 62 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.614466  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0041  RNA-binding S4 domain protein  54.1 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4907  RNA-binding S4  54.55 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.93545  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1824  RNA-binding S4  56.14 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0004  RNA-binding S4  54.72 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000361246  hitchhiker  0.0000000730719 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06080  hypothetical protein  44.29 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0831  hypothetical protein  54.24 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.366919  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0003  S4-like RNA binding protein  43.08 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1224  hypothetical protein  51.79 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0985687 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0003  RNA-binding S4 domain protein  52.94 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.518781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1693  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.12 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0200012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0003  RNA-binding S4 domain protein  51.72 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.241542  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2522  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.73 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0154969 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000219  hypothetical protein  50 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1647  RNA-binding S4  55 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.423975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0112  RNA-binding S4 domain protein  54.24 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.361623  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05955  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1502  RNA-binding S4  54.72 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1301  RNA-binding S4 domain protein  55 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517293  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0003  S4-like RNA binding protein  47.54 
 
 		 73 aa  57  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3530  RNA-binding S4 domain protein  53.45 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.36 
 
 		 67 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0130697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2576  RNA-binding S4 domain protein  53.45 
 
 		 71 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22660  hypothetical protein  49.15 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.294703  normal  0.222073 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5317  hypothetical protein  45.76 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0232645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0003  hypothetical protein  45.76 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000654454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0003  hypothetical protein  47.46 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0881433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0003  S4 region YaaA family protein  47.46 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0003  hypothetical protein  45.76 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0003  hypothetical protein  45.76 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0003  hypothetical protein  45.76 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0003  hypothetical protein  45.76 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0003  hypothetical protein  45.76 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0003  hypothetical protein  45.76 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000693166  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13901  S4 domain-containing protein  52.94 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.453758 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0003  hypothetical protein  45.76 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5767  hypothetical protein  50.85 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0409  hypothetical protein  45.31 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000857637  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2003  RNA-binding S4 domain protein  45.9 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0003  S4-like RNA binding protein  41.54 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000208957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04773  hypothetical protein  45.61 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.97 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2197  hypothetical protein  53.7 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3228  hypothetical protein  44.26 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.199941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0003  S4 domain protein YaaA  46.88 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0676  RNA-binding S4  47.46 
 
 		 71 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1328  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.38 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1365  RNA-binding S4 domain protein  50.91 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000548467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2636  putative RNA-binding protein  45.45 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0140325  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09391  S4 domain-containing protein  50.98 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185916 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1264  RNA-binding S4  47.46 
 
 		 76 aa  50.8  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0046  hypothetical protein  48.15 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6671  hypothetical protein  45.61 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.0976686 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3069  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.37 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000897832  hitchhiker  0.000868663 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0003  S4 domain-containing protein  43.1 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0003  S4 domain protein YaaA  47.46 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000126771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1729  RNA-binding S4 domain protein  46.67 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180543  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2237  hypothetical protein  48.15 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0798  hypothetical protein  45.45 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123896 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0526  hypothetical protein  45.61 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0003  S4 region, YaaA  37.1 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2642  RNA-binding S4 domain-containing protein  40 
 
 		 76 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0497559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2211  hypothetical protein  47.27 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0528785  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1515  RNA-binding S4 domain protein  38.33 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.686645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1092  hypothetical protein  45.45 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>