89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2397 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2397  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 		 77 aa  147  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0714362  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1301  RNA-binding S4 domain protein  54.29 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517293  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1088  RNA-binding S4 domain protein  49.33 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1328  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.52 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1693  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.05 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0200012  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22660  hypothetical protein  52.38 
 
 		 72 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.294703  normal  0.222073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1729  RNA-binding S4 domain protein  59.32 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180543  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3643  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.79 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06080  hypothetical protein  56.67 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5767  hypothetical protein  61.02 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1607  RNA-binding S4 domain protein  52.38 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.932623 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1365  RNA-binding S4 domain protein  50.85 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000548467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2770  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.57 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.013443  normal  0.790943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0126  RNA-binding S4 domain protein  44.62 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3156  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.914223  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0112  RNA-binding S4 domain protein  45.71 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.361623  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3096  RNA-binding S4  50 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3116  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.28 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3479  RNA-binding S4  53.45 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0046  hypothetical protein  45.45 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.67 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0041  RNA-binding S4 domain protein  41.67 
 
 		 67 aa  53.5  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0110  hypothetical protein  43.86 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04773  hypothetical protein  45.16 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0002  RNA-binding S4 domain protein  38.98 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000678168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.51 
 
 		 71 aa  50.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1157  hypothetical protein  40.98 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0334901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2197  hypothetical protein  42.62 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0003  S4-like RNA binding protein  40 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07580  hypothetical protein  36.99 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.87858  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0003  S4 domain protein YaaA  36.36 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0003  S4 region, YaaA  42.86 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0386838  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0003  S4 region YaaA family protein  42.86 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0799775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6817  hypothetical protein  46.15 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1550  S4 domain protein YaaA  38.98 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.715034  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2551  hypothetical protein  41.82 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.28368  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0968  hypothetical protein  35.09 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190489  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0972  hypothetical protein  35.09 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0910033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0003  S4 domain protein YaaA  40 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0003  S4 domain protein YaaA  39.66 
 
 		 73 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000126771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2823  hypothetical protein  36.84 
 
 		 73 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0464209  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1042  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0649  hypothetical protein  43.14 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0586  hypothetical protein  43.14 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0256741 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2938  hypothetical protein  36.84 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196039  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0081  RNA-binding S4  43.48 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1687  hypothetical protein  35.09 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.643727  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0003  RNA-binding S4 domain protein  35.59 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.241542  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0589  hypothetical protein  43.14 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.725964  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0503  hypothetical protein  36.84 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000422283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2510  hypothetical protein  36.84 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000911795  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2771  hypothetical protein  36.84 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00316834  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2155  hypothetical protein  35.59 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.323809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2884  hypothetical protein  36.84 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1834  hypothetical protein  36.84 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0149554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.212549  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3548  RNA-binding S4 domain protein  45.9 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0985  hypothetical protein  42 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523788  normal  0.0666799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4907  RNA-binding S4  47.62 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.93545  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0735  hypothetical protein  36.84 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.673905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0805  hypothetical protein  36.84 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2522  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.29 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0154969 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1437  RNA-binding S4 domain-containing protein  42 
 
 		 62 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.614466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5317  hypothetical protein  39.22 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0232645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0003  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000654454  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0613  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1092  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1051  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751549  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0003  hypothetical protein  36.84 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0881433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0003  hypothetical protein  35.09 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0003  hypothetical protein  35.09 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0003  hypothetical protein  35.09 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0832  hypothetical protein  35.94 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.17612  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4205  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00355095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0003  S4 region YaaA family protein  36.84 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0594  hypothetical protein  41.18 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.705899  normal  0.0117354 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0003  S4-like RNA binding protein  37.93 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0003  S4-like RNA binding protein  31.03 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000208957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0003  hypothetical protein  35.09 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0003  hypothetical protein  35.09 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000693166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0003  hypothetical protein  35.09 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0003  hypothetical protein  35.09 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0587  hypothetical protein  41.18 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0173  S4 domain protein YaaA  32.31 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0789  hypothetical protein  33.33 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2211  hypothetical protein  31.58 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0528785  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.46 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0130697 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0798  hypothetical protein  31.58 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123896 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>