118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2155 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2155  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.323809  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1990  hypothetical protein  61.29 
 
 
125 aa  136  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2237  hypothetical protein  46.55 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0003  S4 domain protein YaaA  50.85 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313437  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0003  S4-like RNA binding protein  44.58 
 
 
148 aa  62  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0003  S4 region, YaaA  52.54 
 
 
73 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5317  hypothetical protein  50.88 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0232645  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0003  S4 domain protein YaaA  50 
 
 
73 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000126771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0003  hypothetical protein  52.63 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0003  hypothetical protein  52.63 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0003  hypothetical protein  52.63 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0003  hypothetical protein  52.63 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0003  hypothetical protein  52.63 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0003  hypothetical protein  52.63 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000693166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0003  hypothetical protein  50.88 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000654454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0003  hypothetical protein  52.63 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0003  hypothetical protein  50.88 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0881433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0003  S4 region YaaA family protein  50.88 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0003  S4 domain protein YaaA  57.69 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1502  RNA-binding S4  43.94 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2197  hypothetical protein  37.31 
 
 
83 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0003  S4-like RNA binding protein  47.27 
 
 
73 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000208957  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0789  hypothetical protein  37.88 
 
 
73 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0098  RNA-binding S4  51.92 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000456096  normal  0.262898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0735  hypothetical protein  39.39 
 
 
73 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.673905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0805  hypothetical protein  39.39 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2551  hypothetical protein  57.69 
 
 
78 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.28368  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1042  hypothetical protein  34.85 
 
 
72 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0342  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.27 
 
 
65 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000486446  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2942  hypothetical protein  34.85 
 
 
72 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161302  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0112  RNA-binding S4 domain protein  38.98 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.361623  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0968  hypothetical protein  36.36 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190489  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6817  hypothetical protein  37.29 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.08 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2457  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.43 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1693  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.98 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0200012  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0003  S4 region, YaaA  55.77 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0386838  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0003  S4 region YaaA family protein  55.77 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0799775  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0972  hypothetical protein  36.36 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0910033  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0798  hypothetical protein  33.33 
 
 
72 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123896 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1550  S4 domain protein YaaA  32.84 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0832  hypothetical protein  34.33 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.17612  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0618  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.36 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0613  hypothetical protein  34.85 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1092  hypothetical protein  34.85 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1051  hypothetical protein  34.85 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751549  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1515  RNA-binding S4 domain protein  38.46 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.686645 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0003  S4-like RNA binding protein  51.85 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0003  S4-like RNA binding protein  42.55 
 
 
49 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  4.31544e-26 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1224  hypothetical protein  31.34 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0985687 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4205  hypothetical protein  34.85 
 
 
72 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00355095  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0503  hypothetical protein  33.33 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000422283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4907  RNA-binding S4  38.24 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.93545  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2938  hypothetical protein  33.33 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196039  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1687  hypothetical protein  33.33 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.643727  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2510  hypothetical protein  33.33 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000911795  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2771  hypothetical protein  33.33 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00316834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2884  hypothetical protein  33.33 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1834  hypothetical protein  33.33 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0149554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2823  hypothetical protein  33.33 
 
 
73 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0464209  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0110  hypothetical protein  35.82 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0003  S4 domain-containing protein  44 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0003  S4 domain-containing protein  44 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0041  RNA-binding S4 domain protein  33.33 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2642  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.79 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0497559  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1301  RNA-binding S4 domain protein  38.18 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517293  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1607  RNA-binding S4 domain protein  39.62 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.932623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5767  hypothetical protein  36.67 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1650  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.43 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.944903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1635  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.43 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0673485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1672  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.43 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2211  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0528785  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2708  RNA-binding S4 domain protein  34.43 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.368118  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0003  RNA-binding S4 domain protein  38.33 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.241542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0464  S4 domain-containing protein  37.5 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0103248  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2510  RNA-binding S4  32.81 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6671  hypothetical protein  35.71 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.0976686 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0414  RNA-binding S4 domain protein  41.07 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1088  RNA-binding S4 domain protein  39.62 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115578  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0053  RNA-binding S4 domain protein  33.33 
 
 
74 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.525969  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2522  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.99 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0154969 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0002  RNA-binding S4 domain protein  38.33 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000678168  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1264  RNA-binding S4  36.07 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3116  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.67 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147068  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3643  RNA-binding S4 domain-containing protein  35 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252029  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0081  RNA-binding S4  41.51 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3096  RNA-binding S4  36.67 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0003  RNA-binding S4  37.5 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000218407  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3156  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.67 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.914223  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2373  RNA-binding S4  36.36 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf004  hypothetical protein  32 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2003  RNA-binding S4 domain protein  32.31 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0126  RNA-binding S4 domain protein  39.62 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0676  RNA-binding S4  26.87 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22660  hypothetical protein  33.33 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.294703  normal  0.222073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.35 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0130697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2397  RNA-binding S4 domain protein  35.59 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0714362  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1157  hypothetical protein  31.34 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0334901  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2770  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.6 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.013443  normal  0.790943 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00030  RNA-binding S4 domain protein  38.71 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>