79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0004 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_0004  RNA-binding S4  100 
 
 		 61 aa  127  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000361246  hitchhiker  0.0000000730719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0464  S4 domain-containing protein  54.72 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0103248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00030  RNA-binding S4 domain protein  51.72 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4907  RNA-binding S4  50 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.93545  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1437  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.73 
 
 		 62 aa  60.1  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.614466  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0081  RNA-binding S4  50.85 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2373  RNA-binding S4  49.09 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0618  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1824  RNA-binding S4  56 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3479  RNA-binding S4  49.09 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10651  S4 domain-containing protein  45.28 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0278753 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09031  hypothetical protein  52.17 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2293  RNA-binding S4 domain protein  49.06 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26047 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13901  S4 domain-containing protein  58.33 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.453758 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0383  RNA-binding S4  45.28 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1550  S4 domain protein YaaA  50.94 
 
 		 71 aa  57  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.715034  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0003  S4 domain protein YaaA  44.07 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0003  RNA-binding S4 domain protein  46.55 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.518781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0972  RNA-binding S4  52.17 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10421  S4 domain-containing protein  52.17 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09391  S4 domain-containing protein  54.35 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.94 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.212549  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10421  S4 domain-containing protein  52.17 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0126  RNA-binding S4 domain protein  45.76 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0831  hypothetical protein  54 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.366919  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0414  RNA-binding S4 domain protein  47.17 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.06 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0130697 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0098  RNA-binding S4  49.06 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000456096  normal  0.262898 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0173  S4 domain protein YaaA  44.23 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0002  RNA-binding S4 domain protein  41.07 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000678168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0342  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.06 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000486446  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2576  RNA-binding S4 domain protein  43.64 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.4 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0003  RNA-binding S4 domain protein  45.45 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.241542  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3530  RNA-binding S4 domain protein  43.64 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2770  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.43 
 
 		 78 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.013443  normal  0.790943 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1693  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.83 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0200012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2197  hypothetical protein  46.55 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1365  RNA-binding S4 domain protein  40.68 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000548467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3096  RNA-binding S4  42.86 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3156  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.86 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.914223  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3116  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.86 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6817  hypothetical protein  43.64 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1607  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 		 76 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.932623 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0003  S4 domain-containing protein  43.64 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0003  S4 domain-containing protein  43.64 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1301  RNA-binding S4 domain protein  52.17 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517293  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0053  RNA-binding S4 domain protein  52 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.525969  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2454  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.07 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000184888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3643  RNA-binding S4 domain-containing protein  48 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2524  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.07 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0627424  unclonable  0.0000273439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2616  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.07 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000166621 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0003  RNA-binding S4  52 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000218407  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0112  RNA-binding S4 domain protein  42.86 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.361623  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1328  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.67 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1729  RNA-binding S4 domain protein  46.03 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180543  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06080  hypothetical protein  45.1 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1527  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.04 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1088  RNA-binding S4 domain protein  45.65 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2708  RNA-binding S4 domain protein  38.18 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.368118  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1672  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.18 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22660  hypothetical protein  47.83 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.294703  normal  0.222073 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1635  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.18 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0673485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1650  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.18 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.944903  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04773  hypothetical protein  38.89 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0110  hypothetical protein  44.68 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0046  hypothetical protein  44 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1264  RNA-binding S4  39.62 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001495 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1647  RNA-binding S4  41.82 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.423975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2522  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.18 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0154969 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  50.94 
 
 		 272 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2642  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.36 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0497559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2457  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.66 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2003  RNA-binding S4 domain protein  37.5 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2510  RNA-binding S4  38.89 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1167  hypothetical protein  41.07 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  normal  0.0222508 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0414  RNA-binding S4 domain protein  45.28 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0499509  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0369  pseudouridine synthase  47.83 
 
 		 251 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>