More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0014 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  217  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  137  7e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  135  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  134  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  133  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.36 
 
 
112 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  59.43 
 
 
109 aa  131  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  130  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  130  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  56.25 
 
 
112 aa  130  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  59.26 
 
 
112 aa  130  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  59.26 
 
 
112 aa  130  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  130  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  130  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.93 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  55.36 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  57.41 
 
 
112 aa  130  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  53.57 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  54.63 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  128  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  128  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  128  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  128  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  128  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.41 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  127  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  127  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  127  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  126  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  126  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  55.36 
 
 
112 aa  126  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  57.41 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  57.41 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  57.41 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3635  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284455 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  52.68 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1123  nitrogen regulatory protein P-II  59.43 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.727128  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  59.43 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>